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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000512`

染色体: Chr05 坐标: 3948785-3951957 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000512`
名称	SmilChr05G000512
描述	cation/H(+) antiporter 15-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3948785 - 3951957 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985234`
GeneID	`130985234`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985234`
原始查询	`LOC130985234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cation/H(+) antiporter 15-like
产物	cation/H(+) antiporter 15-like
Arabidopsis	`AT2G13620` (CHX15) cation/hydrogen exchanger 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815847] identity=45.6; qcov=0.942; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0485000` (OsCHX16) - identity=41.3; qcov=0.952; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0006885 (regulation of pH); GO:0012505 (endomembrane system); GO:0015297 (antiporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00999 (Na_H_Exchanger); PF23256 (CHX17_2nd); PF23259 (CHX17_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985234

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764060.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764060.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764060.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764060.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764060.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3949813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,C16,C48,D10
`Chr5:3950532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:3950850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B27,C16,C48,D10
`Chr5:3950986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr5:3951024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr5:3951141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr5:3951182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:3951220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr5:3951249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr5:3951255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B87,C22,C35,D9
`Chr5:3951556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B91
`Chr5:3951683`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764060.1

831 aa

416

831

Na_H_Exchanger

CHX17_2nd

CHX17_C

PF00999 Na_H_Exchanger 60-423 aa PF23256 CHX17_2nd 484-610 aa PF23259 CHX17_C 620-778 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764060.1`	Pfam	`PF00999`	Na_H_Exchanger	Domain	60	423	2.1e-43	149.3	Sodium/hydrogen exchanger, transmembrane
`XP_057764060.1`	Pfam	`PF23256`	CHX17_2nd	Domain	484	610	1.9e-40	138.6	Plant cation/H(+) antiporter domain
`XP_057764060.1`	Pfam	`PF23259`	CHX17_C	Domain	620	778	1.2e-41	143.0	Plant cation/H(+) antiporter, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908077.1
ACGGGCGACCATGGAAAAAACCAGTTTCCCTCCATATTTCCTCCTCCTCTCTCTCTTCATCCCATCCATCACAAGCAATCTCATTCCATTCCCATCCCATTCCAAGAAGCCGGGGTAGCTGTTGCCCTGCCATAACGCGGAGGAGGAAGAAGAGGAGGCCGCCGCGGCGCATGAGGTGGCGGCGGTAGCAGCAGCAATGGCGGCAATTCCAGGGATCATGGATATTGCCAAGCTAAACCAAACCATTCTGTGCTACGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985234
ATGGCGGCAATTCCAGGGATCATGGATATTGCCAAGCTAAACCAAACCATTCTGTGCTACGCCGAAACCATTTACCGGTTCAATGGCCTTTGGGAAGGACCCGATCCATTGACCCCCCTCATTTCTCTCTTCCTCATCCAGCTCACCTTCTCCATGGGCGTCATCCACCTCCTCGTCTTCGCTCTTAAACCCTCCAACCAACCTCCATTCATCGCAGAAGTTCTCGGCGGTATACTATTAGGGCCGACCGTGTTTGGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764060.1
MAAIPGIMDIAKLNQTILCYAETIYRFNGLWEGPDPLTPLISLFLIQLTFSMGVIHLLVFALKPSNQPPFIAEVLGGILLGPTVFGRIAAYRKLAFPNYSFRILEPMAHLSITYYAFLVGLKMDVKGIMRTGPKAMKVALAGIIIPFSIGAGLYFIFQIDKPERAGCLFWGAALTVTGFSVLTDILDKQQMLHTESGKTALSSALINEMCSWGFLALGFAVTSSQSSIQWSVMSTAAFALVCVYFVRPGLSWLIHRAPEG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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