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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000541`

染色体: Chr05 坐标: 4139977-4145802 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000541`
名称	SmilChr05G000541
描述	protein SCD5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4139977 - 4145802 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985235`
GeneID	`130985235`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985235`
原始查询	`LOC130985235`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SCD5-like
产物	protein SCD5-like
Arabidopsis	`AT1G29370` (AT1G29370) RNA polymerase II degradation factor-like protein (DUF1296) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839812] identity=39.2; qcov=1.08; evalue=1.58e-142; confidence=medium
Rice	`Os01g0663800` (P0003E08.2-1) - identity=35.6; qcov=0.634; evalue=1.1e-58; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF06972 (GIP1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985235

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764061.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057764061.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057764062.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057764062.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057764062.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4140172`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A19,A25,B129,B135,B18,B37,B47,B55,B69,B72,B83,B84,C10,C2,C34,C52,C54,C56,C7,C75,C84
`Chr5:4140174`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A19,A25,B129,B135,B18,B37,B47,B55,B69,B72,B83,B84,C10,C2,C34,C52,C54,C56,C7,C75,C84
`Chr5:4140185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:4140187`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A1,B1,B119,B124,B128,B132,B137,B18,B41,B50,B65,B72,B85,C25,C28,C29,C32,C46,C6,C65,C68,D4
`Chr5:4140729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C21,C43
`Chr5:4140942`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	61	A1,A2,A22,A5,A8,B1,B11,B119,B121,B124,B126,B128,B130,B132,B135,B137,B139,B140,B18,B19,B28,B30,B31,B33,B37,B41,B48,B49,B50,B53,B65,B71,B72,B74,B77,B85,B86,B91,C20,C23,C25,C28,C29,C32,C37,C46,C47,C6,C60,C65,C67,C68,C72,C76,C78,C8,C80,C85,D1,D4,D6
`Chr5:4140944`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	46	A1,A2,A5,B1,B11,B119,B121,B124,B126,B128,B130,B132,B135,B137,B140,B18,B19,B37,B41,B49,B50,B65,B71,B72,B74,B77,B85,B86,C20,C23,C25,C28,C29,C32,C37,C46,C47,C6,C65,C67,C68,C8,C80,D1,D4,D6
`Chr5:4140976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B73
`Chr5:4141363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:4141374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr5:4142258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:4142602`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B51,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764061.1

828 aa

414

828

GIP1_N

PF06972 GIP1_N 19-77 aa

XP_057764062.1

793 aa

396

793

GIP1_N

PF06972 GIP1_N 19-77 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764061.1`	Pfam	`PF06972`	GIP1_N	Domain	19	77	1.2e-27	96.6	GBF-interacting protein 1 N-terminal
`XP_057764062.1`	Pfam	`PF06972`	GIP1_N	Domain	19	77	1.1e-27	96.6	GBF-interacting protein 1 N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908079.1
AGAATTTAGAAAATAGGAAAGAACTTGAGATATTATCACCGGTATAGAGAGAGAAGTTTTCAGAGAGAGAAACAGCGAAGGGTTTGCAACGGAAGCTGCTGATTTTCAAAAACCGCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTACTTCTACTATTCCTAATACTTGTACTTATATAGCCGAAAACACCAATTACTGTGTGTTTTTTCCGCCTCTTGCTTGAAGTGAGCTACTACAGCTATATATATATGTATCGAGTCATCGAGGT...

XM_057908078.1
AGAATTTAGAAAATAGGAAAGAACTTGAGATATTATCACCGGTATAGAGAGAGAAGTTTTCAGAGAGAGAAACAGCGAAGGGTTTGCAACGGAAGCTGCTGATTTTCAAAAACCGCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTACTTCTACTATTCCTAATACTTGTACTTATATAGCCGAAAACACCAATTACTGTGTGTTTTTTCCGCCTCTTGCTTGAAGTGAGCTACTACAGCTATATATATATGTATCGAGTCATCGAGGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985235
ATGAGTGCGAGGAAGGGAAAGGGCGCCGCCGGCAATGTTGGCGGCCAGCAATCCATTCCGGCCAGCGCGCGGAAGTTGGTTCAAACCTTGAAGGAGATAGTTAACTGCACGGAGGCGGAGATCTATGCCGCTCTCAAGGAATGCAATATGGACCCTAACGACGCCTTCAATCTTCTTGTCTCTCAAGATCCTTTCCGCGAGGTGAAAAGTAAACGAGAAAAGAAAAAAGAGGGAAAAGACACTACTGAACCTAAGTCTCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764061.1
MSARKGKGAAGNVGGQQSIPASARKLVQTLKEIVNCTEAEIYAALKECNMDPNDAFNLLVSQDPFREVKSKREKKKEGKDTTEPKSRGANNNPGRTGKTGADRFRGGPTHSSSESVTLPGKTTYKKESAISGNNRRVSAGPSDGATAENKGFSLGATETTPSGVQPASGYQSAGVGASGQVSMADIVKMGRSLNKTSNAPDASSAQDIPISEEWPTMEKPPATQVSSAPYYAVDSEQHPVPPSDSFNRQSEAEEVQGVEE...

XP_057764062.1
MSARKGKGAAGNVGGQQSIPASARKLVQTLKEIVNCTEAEIYAALKECNMDPNDAFNLLVSQDPFREVKSKREKKKEGKDTTEPKSRGANNNPGRTGKTGADRFRGGPTHSSSESVTLPGKTTYKKESAISGNNRRVSAGPSDGATAENKGFSLGATETTPSGVQPASGYQSAGVGASGQVSMADIVKMGRSLNKTSNAPDASSAQDIPISEEWPTMEKPPATQVSSAPYYAVDSEQHPVPPSDSFNRQSEAEEVQGVEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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