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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000617`

染色体: Chr05 坐标: 4652714-4655093 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000617`
名称	SmilChr05G000617
描述	L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4652714 - 4655093 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985244`
GeneID	`130985244`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985244`
原始查询	`LOC130985244`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
产物	L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
Arabidopsis	`AT5G10530` (AT5G10530) Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830918] identity=44.1; qcov=0.92; evalue=1.87e-151; confidence=medium
Rice	`Os07g0569550` (OJ1019_E02.19) - identity=42.7; qcov=1.01; evalue=2.36e-167; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00139 (Lectin_legB); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985244

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764081.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764081.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764081.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764081.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764081.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4652889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B13,B56,B8,C17
`Chr5:4653040`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	92	A10,A14,A20,A21,A4,A6,A7,B105,B106,B110,B111,B112,B118,B12,B121,B124,B126,B13,B131,B133,B134,B137,B15,B16,B18,B22,B25,B28,B29,B3,B30,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B45,B47,B5,B56,B58,B59,B64,B70,B74,B77,B82,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B95,B99,C1,C11,C13,C14,C17,C20,C21,C26,C27,C28,C35,C40,C44,C50,C51,C55,C59,C60,C63,C64,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C79,C80,C81,C84,C87,C9,D1,D2,D6
`Chr5:4653053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B32
`Chr5:4653053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr5:4653104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,C82
`Chr5:4653150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C25,C32,C68
`Chr5:4653196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:4653198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B91
`Chr5:4653201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B102,B54,C73
`Chr5:4653225`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	106	A14,A15,A18,A21,A24,A4,A5,A6,A8,A9,B101,B106,B112,B118,B12,B120,B121,B124,B125,B126,B127,B13,B130,B135,B137,B139,B140,B15,B16,B18,B21,B22,B28,B29,B3,B32,B33,B35,B36,B38,B39,B41,B44,B45,B47,B5,B50,B51,B52,B56,B58,B59,B62,B70,B74,B75,B8,B84,B85,B87,B88,B89,B90,B92,B95,B96,B97,C1,C13,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C24,C25,C27,C28,C31,C32,C35,C47,C50,C51,C53,C55,C59,C60,C62,C64,C66,C68,C70,C71,C72,C73,C76,C77,C79,C81,C87,D1,D2,D8
`Chr5:4653228`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	168	A10,A11,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A21,A24,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B100,B101,B102,B105,B106,B108,B110,B111,B112,B118,B12,B120,B121,B123,B124,B125,B126,B127,B13,B130,B133,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B18,B20,B21,B22,B24,B25,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B43,B44,B45,B47,B49,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B56,B58,B59,B60,B61,B62,B64,B70,B72,B74,B75,B77,B8,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C31,C32,C33,C35,C36,C38,C40,C41,C44,C46,C47,C48,C49,C50,C51,C53,C55,C59,C60,C62,C63,C64,C66,C68,C69,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C79,C80,C81,C82,C84,C86,C87,C9,D1,D2,D3,D6,D8
`Chr5:4653262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764081.1

687 aa

344

687

Lectin_legB

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF00139 Lectin_legB 21-262 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 348-552 aa PF00069 Pkinase 349-614 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764081.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	21	262	7.4e-58	196.7	Legume lectin domain
`XP_057764081.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	348	552	7e-45	154.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057764081.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	349	614	8.8e-50	170.3	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908098.1
TTCTTCTCTAACCATCACAAAAATTGTCGGAGGAGGGTCCAGTGAAGTCAAGTCTTCCCCTTTCTTCTCTAACCATCACAAAAAATTTCTTTATATCTTGAATTCATCAAATTTTCACCATCATTTTCTTGTAAAAATTAAACAAGTGCAGCCATAGCCATGTCTACACCCGTTTCCATGTTTCTCCTCCTCACCTTGTTCGTCTATGCAACATTCTCACTATCCTTCGACATGTCTCCCATCACAATATCAGACGGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985244
ATGTCTACACCCGTTTCCATGTTTCTCCTCCTCACCTTGTTCGTCTATGCAACATTCTCACTATCCTTCGACATGTCTCCCATCACAATATCAGACGGCGACCGCCTCAACCTCACCGGAGACGCCTACATCACCGACGAAGGCATCCAAGTCACAACGAATCAAACGGAGAGAGCCGGGCGAGCCACCTACGGTGAGCTGCTGCATTTGTGGGACAAAACCTCACAAAATGTGGCTGATTTCTCCACACACTTCTCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764081.1
MSTPVSMFLLLTLFVYATFSLSFDMSPITISDGDRLNLTGDAYITDEGIQVTTNQTERAGRATYGELLHLWDKTSQNVADFSTHFSFVINSFGSDKFGDGLTFFLAPNGSTIKPSSRASGLGLGYPKSPPDSSSLEAFVAVEFDTYRNQFIDPTYEGGPDVPHVGIDLSNLSSVQTTNWYNNISAGAQNDAWVTYNSSTCILRVDFTGTYNGTFRQGNLSYEVSLRNYLPEYVTIGFSASTGGSFEENNVKSWSFNSTDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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