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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000631`

染色体: Chr05 坐标: 4758784-4761840 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000631`
名称	SmilChr05G000631
描述	calmodulin-binding receptor kinase CaMRLK
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4758784 - 4761840 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985245`
GeneID	`130985245`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985245`
原始查询	`LOC130985245`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calmodulin-binding receptor kinase CaMRLK
产物	calmodulin-binding receptor kinase CaMRLK
Arabidopsis	`AT5G45800` (MEE62) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834620] identity=53.2; qcov=0.969; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0276400` - identity=37.2; qcov=0.939; evalue=2.37e-111; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF12799 (LRR_4); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985245

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764082.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764082.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764082.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764082.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764082.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4759157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:4759183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:4759342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr5:4759459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:4759619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr5:4760239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:4760260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B34
`Chr5:4760267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B27,B36
`Chr5:4760277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:4760350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B136,B23,C38,C74
`Chr5:4760531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B78
`Chr5:4760542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764082.1

684 aa

342

684

LRR_8

LRR_1

LRR_6

LRR_1

LRR_6

LRR_4

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF13855 LRR_8 55-112 aa PF00560 LRR_1 77-97 aa PF13516 LRR_6 149-161 aa PF00560 LRR_1 150-172 aa PF13516 LRR_6 172-187 aa PF12799 LRR_4 173-207 aa PF00560 LRR_1 174-191 aa PF00560 LRR_1 197-219 aa PF00069 Pkinase 411-586 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 412-585 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764082.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	55	112	4.3e-16	59.1	Leucine rich repeat
`XP_057764082.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	77	97	5.1e-13	47.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057764082.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	149	161	1e-06	29.0	Leucine Rich repeat
`XP_057764082.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	150	172	5.1e-13	47.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057764082.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	172	187	1e-06	29.0	Leucine Rich repeat
`XP_057764082.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	173	207	4.7e-16	59.2	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057764082.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	174	191	5.1e-13	47.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057764082.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	197	219	5.1e-13	47.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057764082.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	411	586	4.9e-14	53.1	Protein kinase domain
`XP_057764082.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	412	585	9.5e-25	88.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908099.1
ATTTTGTGTTGATTATTAGTATGAAAACCAAGTGTATTTAATTTGAAGAATAAGCATAGAGAATCTGTGTCCACTAAACAGTGTTGTTTAGCTAGTGGTTCTGTTTTGGTCTTCTCCATGTTTGTAAGTTGAGTAGTTGACGAGTCCAAACTCACAAAGAAGCAGACCACCACTCCACCACCACCGCCTTCAATAACTACATAATGTGACAGTAGCTCAGATCTCTCTTTCTCTCTCTGCATCCATGAAATGAAAACCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985245
ATGAAAACCATGCTCAGATTCATGCTCCTCATCTCTCTCCTCTCTCTATCCGAATCATCACCGTGCAGCAACACCTCAGACCGCGCCCTGCTCGCCAAGGCATTCGCCTCCGTTTCCGGCTTCGAACCTTCCTGGTTCTTCAACACCAGCTGCTCCGTCTCCCAAATCAACCTCTCCTCCAGAAACCTCACCGGCGCTATCTCATGGAAACACCTCACAAACATCACGCACCTGCGCGCCTTAGATCTCTCCGCCAATCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764082.1
MKTMLRFMLLISLLSLSESSPCSNTSDRALLAKAFASVSGFEPSWFFNTSCSVSQINLSSRNLTGAISWKHLTNITHLRALDLSANRLTGSVPPSLWLLPNLAEINLSNNRLGGAAGLPKPASLSSSPLRKIDLSFNRFRNFTYLSNFPNLTSLNLSGNDFRVALPLWFTNLTNLQSLDISGCNISGNLSPISGLKSLKHLDISINRFTGNFPADIPSLVNLSFFNISFNNVSGFLDSKYVHKFGSSAFIHAGNLTTRNK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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