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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000637`

染色体: Chr05 坐标: 4812746-4816459 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000637`
名称	SmilChr05G000637
描述	uncharacterized SmilChr05G000637
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4812746 - 4816459 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985246`
GeneID	`130985246`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985246`
原始查询	`LOC130985246`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit, putative (DUF688) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839798]; symbol=AT1G29240; hit=AT1G29240; species=arabidopsis; confidence=low
产物	transcription initiation factor TFIID subunit, putative (DUF688) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839798]; symbol=AT1G29240; hit=AT1G29240; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G29240` (AT1G29240) transcription initiation factor TFIID subunit, putative (DUF688) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839798] identity=30.7; qcov=1.04; evalue=1.25e-50; confidence=low
Rice	`Os01g0758900` - identity=30.7; qcov=0.419; evalue=1.58e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05097 (DUF688)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985246

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764083.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057764083.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057764083.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764083.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764083.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4813118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr5:4813132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D6
`Chr5:4813267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:4813496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C54
`Chr5:4813580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B138,B64
`Chr5:4813622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr5:4813643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B47,C65
`Chr5:4813770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:4813796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:4813800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr5:4814178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B34
`Chr5:4814193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764083.1

661 aa

330

661

DUF688

PF05097 DUF688 1-478 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764083.1`	Pfam	`PF05097`	DUF688	Family	1	478	4e-84	284.1	Protein of unknown function (DUF688)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908100.1
AATCAAGAATTGCTATTGGCCCTCCCACTTTATCAAAAAAGAAGAAGAAGAAAAATAATAATTCAGCCCCACCACGTTATACCATCCACATGCATTTCAGTCAGTCAGTAATCAGCGCTACTCCTGCCTACTAAATACTCATTAATCTTAAAAAGCACAACCAAACTCTCTCTCTCTCTCTACCTCTTTTTTCTCCTTTTCTTTTGCCACCATTCGCGGGAAGAAACTCCAAATCGAAGAAATCAGTGGGCTTCTGTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985246
ATGGAAAAAAGGCAACTAGATTTCAATGCACCACTTATGTCTGCAAGGAGATATTCATCACCTTCAAAATCTACTGAGCTAGCAAAACGGAAGGCGGTGGAGAAGCCACCGCCCTCCCGACAGCAATCTCTTCAACCTACGAAATCCTACTGGGAATGTGAGGAGGTGACAATGACCAAACCAGCTTCTGTTCCATTTCACTGGGAGCAGATCCCTGGAAGGCCTAAAGGTGAAGTCGAGAGCCATTCAAATACCCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764083.1
MEKRQLDFNAPLMSARRYSSPSKSTELAKRKAVEKPPPSRQQSLQPTKSYWECEEVTMTKPASVPFHWEQIPGRPKGEVESHSNTPEESNTPRLPPARVSDAMRRSSGEIPKLPPGRLSGPSRYCSGERTNDQNIYRSHVEAFSFTDHASLLERLNDSLNCKDDSDSESGDDSYSDALDTLSLTESWSFNYSVSGISGYLSSGVKPSGTFSIDTQTRDFMMNRFLPAAKAVVLETPEYAVKKPSPLEEKPEKKAVSREMK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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