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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000567`

染色体: Chr05 坐标: 4257504-4261490 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000567`
名称	SmilChr05G000567
描述	transcription factor GTE11-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4257504 - 4261490 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985257`
GeneID	`130985257`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985257`
原始查询	`LOC130985257`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor GTE11-like
产物	transcription factor GTE11-like
Arabidopsis	`AT5G46550` (AT5G46550) DNA-binding bromodomain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834698] identity=35.9; qcov=0.717; evalue=3.41e-58; confidence=medium
Rice	`Os07g0507700` - identity=40.7; qcov=0.7; evalue=8.92e-65; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00439 (Bromodomain)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985257

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764111.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764111.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764111.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764111.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764111.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4257607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:4257642`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr5:4257642`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr5:4257644`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr5:4257644`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr5:4259426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:4259798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:4260043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:4260316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:4260492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764111.1

540 aa

270

540

Bromodomain

PF00439 Bromodomain 145-227 aa

XP_057764112.1

540 aa

270

540

Bromodomain

PF00439 Bromodomain 145-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764111.1`	Pfam	`PF00439`	Bromodomain	Domain	145	227	4.1e-21	75.5	Bromodomain
`XP_057764112.1`	Pfam	`PF00439`	Bromodomain	Domain	145	227	4.1e-21	75.5	Bromodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088927.1
AAGTCTACTTTAGGAATAATAATTTAACCCTCAAAACCAAACTCGCAGACGATACACTTAAAATTAACGCCGCCGCCTCCGCCTCCAAGGCCAGAGTCGACGATTCATCCTTCAACTTCGAAGCTGCTTTTCGGTCCGCACCGGACTTCCTCAGCGTTGTAATTGAAGCATACAATTATAATGGCTGAGAATCAAGCTGAAACGATGTCCTGCTACCCGATGCAATTTCCTGACATGGTTGCTAAAAAGAAGACAATTCG...

XM_057908128.1
AAGTCTACTTTAGGAATAATAATTTAACCCTCAAAACCAAACTCGCAGACGATACACTTAAAATTAACGCCGCCGCCTCCGCCTCCAAGGCCAGAGTCGACGATTCATCCTTCAACTTCGAAGCTGCTTTTCGGTCCGCACCGGACTTCCTCAGCGTTGTAATTGAAGCATACAATTATAATGGCTGAGAATCAAGCTGAAACGATGTCCTGCTACCCGATGCAATTTCCTGACATGGTTGCTAAAAAGAAGACAATTCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985257
ATGGCTGAGAATCAAGCTGAAACGATGTCCTGCTACCCGATGCAATTTCCTGACATGGTTGCTAAAAAGAAGACAATTCGCTGTGCATTGAAGTTCAAGGTAACTACCAAAGGTATATGGAATGTATCAGAAGATAAGTTATGTGAAGGCACTGATGGGCCTTGTATGGTGAAGCCAAGCAAGCAGAAGCCTGAAATGTCTCTTGATGATCAAAGCTGGAAAAAGCAAAAGATGGGCCCTTTTAAAGTTAAGTCATGTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764111.1
MAENQAETMSCYPMQFPDMVAKKKTIRCALKFKVTTKGIWNVSEDKLCEGTDGPCMVKPSKQKPEMSLDDQSWKKQKMGPFKVKSCEGTDRQRNRVSVGVSKPPEANVPVKPLMPVTSGKRKPEMSFDDQRWKKQKMDCSSKLECSKILKDLMNHSVGWAFSEPVDPVKLKIPDYFQIIRNPMDLGTIKHKLERDKYSAAKEFADDVQLTFKNAMSYNPPEDEVHRWAEMLDGTFRRKWKLLDARLKHTNKSDEKTRKVL...

XP_057764112.1
MAENQAETMSCYPMQFPDMVAKKKTIRCALKFKVTTKGIWNVSEDKLCEGTDGPCMVKPSKQKPEMSLDDQSWKKQKMGPFKVKSCEGTDRQRNRVSVGVSKPPEANVPVKPLMPVTSGKRKPEMSFDDQRWKKQKMDCSSKLECSKILKDLMNHSVGWAFSEPVDPVKLKIPDYFQIIRNPMDLGTIKHKLERDKYSAAKEFADDVQLTFKNAMSYNPPEDEVHRWAEMLDGTFRRKWKLLDARLKHTNKSDEKTRKVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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