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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000628`

染色体: Chr05 坐标: 4735616-4738547 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000628`
名称	SmilChr05G000628
描述	nucleobase-ascorbate transporter 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4735616 - 4738547 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985258`
GeneID	`130985258`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985258`
原始查询	`LOC130985258`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleobase-ascorbate transporter 2-like
产物	nucleobase-ascorbate transporter 2-like
Arabidopsis	`AT2G34190` (AT2G34190) Xanthine/uracil permease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817980] identity=83.8; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0759900` - identity=78.8; qcov=0.853; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00860 (Xan_ur_permease)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985258

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764113.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764113.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764113.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764113.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764113.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4735897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B89
`Chr5:4735987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C19
`Chr5:4736410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B40
`Chr5:4736548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B79,C27,C61
`Chr5:4736603`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	162	A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A22,A23,A25,A3,A5,A7,A9,B1,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B112,B113,B115,B117,B118,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B129,B131,B132,B133,B135,B139,B15,B16,B17,B2,B20,B21,B23,B24,B25,B26,B27,B31,B35,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B60,B62,B63,B64,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B73,B76,B78,B79,B8,B81,B83,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B98,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C33,C35,C39,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C53,C55,C56,C57,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C70,C71,C75,C76,C77,C78,C81,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D2,D5,D8,D9
`Chr5:4736795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B79,C27,C61
`Chr5:4736818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:4737787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr5:4738028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:4738163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B6,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764113.1

524 aa

262

524

Xan_ur_permease

PF00860 Xan_ur_permease 34-436 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764113.1`	Pfam	`PF00860`	Xan_ur_permease	Family	34	436	1.2e-63	215.9	Permease family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908130.1
AAGAAACTCTTCAAAGAGTGGGCTTTGCGATTGCCCTCTCACTCACACTCCTCTACTCCTTCATATATATACACAAGATTACGGTCCAATCACATTCACTGTCTCATTACCTGTGTCAACTTTTTCTGCTTTTCTTTTTCTGTATTCATTCCTCCTTTTGCTTTTTCTTCCCCACTTTGGATATCTAATTCACGAGCTCACACCGCATTTTACTGCAAACCAAGACTTTGTTTGTTTTGCATCACTACATCTTCCTCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985258
ATGGCTGCTCCAAAACCAGAGGAAATAAGTCATCCACCGATGGACCAACTCCAAGGCTTGGAGTATTGCATCGATTCTAATCCTTCTTGGGGGGAAGCAACAGCACTTGGATTTCAGCATTATATTTTGGCGTTGGGAACGGCGGTCATGATTCCAACCTTTCTTGTACCGTTGATGGGCGGAACCGATGATGATAAAGTTAGAGTGGTTCAGACATTGCTATTTGTTGGAGGAATAAACACACTGCTGCAGACTTTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764113.1
MAAPKPEEISHPPMDQLQGLEYCIDSNPSWGEATALGFQHYILALGTAVMIPTFLVPLMGGTDDDKVRVVQTLLFVGGINTLLQTLFGTRLPTVIGGSWAFMVPIISIIHDPSLERITDPHVRFMNTMRAIQGALIVASSVQIILGYSQLWAICSRFFSPLGMVPVISLVGFGLLDRGFPVVGRCVEIGIPMLILFIAFSQYLKHFQTREIPVLERFALLLSVTVIWAYAHLLTASGAYKHHPELTQRNCRTDKANLISS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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