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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000614`

染色体: Chr05 坐标: 4613686-4616997 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000614`
名称	SmilChr05G000614
描述	uncharacterized SmilChr05G000614
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4613686 - 4616997 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985262`
GeneID	`130985262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985262`
原始查询	`LOC130985262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SEC61; symbol=SEC61; hit=Os09g0347700; species=rice; confidence=high
产物	SEC61; symbol=SEC61; hit=Os09g0347700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G29310` (AT1G29310) SecY protein transport family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839805] identity=92.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0347700` (SEC61) - identity=93.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005048 (signal sequence receptor activity); GO:0005784 (Sec61 translocon complex); GO:0006616 (SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, translocation); GO:0008320 (transmembrane protein transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0031204 (post-translational protein targeting to membrane, translocation); GO:0043022 (ribosome binding)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00344 (SecY); PF10559 (Plug_translocon)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057764123.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057764123.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057764123.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057764123.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057764123.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4614614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr5:4615238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr5:4616490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764123.1

475 aa

238

475

Plug_translocon

SecY

PF10559 Plug_translocon 42-76 aa PF00344 SecY 77-459 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764123.1`	Pfam	`PF10559`	Plug_translocon	Domain	42	76	5.8e-17	61.9	Plug domain of Sec61p
`XP_057764123.1`	Pfam	`PF00344`	SecY	Family	77	459	7.7e-81	272.5	SecY

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908140.1
AACAAATGACACGTCGTAATTTAGCATCTGACGTGTTGGAAGGCTAGTGGTTGGGAGTCGTGGCACGCATAGACATGAAAAACCTGCACAAAGCACTCAAAAACCCAAGACATTGAAAACTTCTAACAGATCAACGTCGCTCGACTCGATTCAGTTAATATTGCCTTTGCTCCATTGCGCGGTTACTTGGGGTGTTCCGCCTCAAGTCTAACCACTTTCAATTCCTATCTATTGCTCGACGGGTTTGAGAGTTTGTGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985262
ATGGGAGGAGGATTTAGGGTGTTGCATCTTGTGAAGCCATTCCTTTCGTTTCTGCCTGAAGTTCAAAGTGCGGACAGGAAGATTCCCTTCAGAGAGAAAGTTATATACACTGTGATTTCTCTTTTCATATTCTTGGTGTGCAGCCAACTTCCTCTGTATGGCATACATTCCACTACTGGAGGTGATCCTTTCTACTGGATGCGTGCTATTCTTGCATCAAGCCGTGGAACTGTCATGGAGTTGGGTATCACACCCATTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764123.1
MGGGFRVLHLVKPFLSFLPEVQSADRKIPFREKVIYTVISLFIFLVCSQLPLYGIHSTTGGDPFYWMRAILASSRGTVMELGITPIVTSGLVMQLLAGSKIIEVDNNVREDRALLNGAQKLLGILIAVGEAVAYVLSGMYGSVGQLGVGNAILIILQLCFAGIIVICLDELLQKGYGLGSGISLFIATNICENIIWKAFSPTTINSGRGAEFEGAVIALFHLLITRTDKVRALREAFYRQNLPNVTNLLATILIFLIVIY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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