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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000542`

染色体: Chr05 坐标: 4146404-4153035 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000542`
名称	SmilChr05G000542
描述	carboxyl-terminal-processing peptidase 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4146404 - 4153035 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985263`
GeneID	`130985263`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985263`
原始查询	`LOC130985263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carboxyl-terminal-processing peptidase 1, chloroplastic
产物	carboxyl-terminal-processing peptidase 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G46390` (AT5G46390) Peptidase S41 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834682] identity=70.4; qcov=0.997; evalue=3.86e-155; confidence=high
Rice	`Os01g0664000` (OsCttP1) - identity=71.3; qcov=0.983; evalue=5.29e-158; confidence=high
GO	GO:0004175 (endopeptidase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006508 (proteolysis); GO:0008236 (serine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00595 (PDZ); PF03572 (Peptidase_S41); PF17820 (PDZ_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985263

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764124.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057764124.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057764124.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057764125.1`
5	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057764125.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4146500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:4146521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C44,C74
`Chr5:4146525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,C22,D9
`Chr5:4146614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B94,C7
`Chr5:4146656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:4146666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B61,B63,B8,C73
`Chr5:4146804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr5:4146839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B94,C7
`Chr5:4147947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B36,C47
`Chr5:4147984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C82
`Chr5:4147985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C82
`Chr5:4147998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764124.1

474 aa

237

474

PDZ

PDZ_6

Peptidase_S41

PF00595 PDZ 182-255 aa PF17820 PDZ_6 209-255 aa PF03572 Peptidase_S41 292-452 aa

XP_057764125.1

298 aa

149

298

PDZ

PDZ_6

Peptidase_S41

PF00595 PDZ 7-79 aa PF17820 PDZ_6 33-79 aa PF03572 Peptidase_S41 116-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764124.1`	Pfam	`PF00595`	PDZ	Domain	182	255	1.5e-07	32.4	PDZ domain
`XP_057764124.1`	Pfam	`PF17820`	PDZ_6	Domain	209	255	2.5e-07	31.0	PDZ domain
`XP_057764124.1`	Pfam	`PF03572`	Peptidase_S41	Family	292	452	7.2e-50	169.5	Peptidase family S41
`XP_057764125.1`	Pfam	`PF00595`	PDZ	Domain	7	79	9.2e-08	33.1	PDZ domain
`XP_057764125.1`	Pfam	`PF17820`	PDZ_6	Domain	33	79	1.1e-07	32.1	PDZ domain
`XP_057764125.1`	Pfam	`PF03572`	Peptidase_S41	Family	116	276	2.5e-50	171.0	Peptidase family S41

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908141.1
TTTAGCGGCATAAAGCAGCAGAAAGAGAAATATAGAGTGAGAGATGGTGAGGCTTCTACTCTGCAACTCCTCACTATCACCACTCTCCCCACCGCCGCCGCCGAAGCCAGCCTTCGTCACTCCTCCGATCGGAAAGTCTATCCCGACAAGGAAATCAGATTATTGGCAGAAAACTCCGTCAATTTCTCAGGCATTAAGTTCGACTCTGATCTCCTTAGCACTCTCCTTAGGGATTTTCTGCGCATCTCCTTCCCATTCAA...

XM_057908142.1
TGGTCTCCTGATTCGTGGCTTAAGAAGAAGGAAGATGTGTTAGGCCGCTCGATTCAGTCACGATCAAGAGCGCACGATATAGTTAGACGAATGTTGGCGAGCTTGGGAGACCCCTACACGCGTTTTCTCCCTCCCACTGATTTTTCTTATTCCATGGCTTGTGTTGGTTCCGTCATGAACAAAAGTTCGCCAAGATGGCAAGGTATGATATGTCTGGAATTGGGATAAACCTGAGGGAAATTCCAGATGACAATGGAATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985263
ATGGTGAGGCTTCTACTCTGCAACTCCTCACTATCACCACTCTCCCCACCGCCGCCGCCGAAGCCAGCCTTCGTCACTCCTCCGATCGGAAAGTCTATCCCGACAAGGAAATCAGATTATTGGCAGAAAACTCCGTCAATTTCTCAGGCATTAAGTTCGACTCTGATCTCCTTAGCACTCTCCTTAGGGATTTTCTGCGCATCTCCTTCCCATTCAACCGCCCTAGAATCAGTTGCTCCGCAACAAGAGCTGATTTGCCG...

LOC130985263
ATGGCAAGGTATGATATGTCTGGAATTGGGATAAACCTGAGGGAAATTCCAGATGACAATGGAATGCCGAGATTGAGGGTGTTAGGGCTTCTTCTGGAGGGCCCTGCCCACTCTGCTGGCATTAGACAGGGTGACGAGCTACTGGCTGTTAATGGGGTTGATGTGAAAGGAAAATCAGCATTTGAAGCATCATCAATGTTACAAGGACCCAGTGAAACATTTGTCGACGTCACGGTCAAGCATGGGAACTGTGGGTCTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764124.1
MVRLLLCNSSLSPLSPPPPPKPAFVTPPIGKSIPTRKSDYWQKTPSISQALSSTLISLALSLGIFCASPSHSTALESVAPQQELICREYDDYADDKSTGEAVTNEEIVEEAWQIVNDSFLETGRQSWSPDSWLKKKEDVLGRSIQSRSRAHDIVRRMLASLGDPYTRFLPPTDFAKMARYDMSGIGINLREIPDDNGMPRLRVLGLLLEGPAHSAGIRQGDELLAVNGVDVKGKSAFEASSMLQGPSETFVDVTVKHGNC...

XP_057764125.1
MARYDMSGIGINLREIPDDNGMPRLRVLGLLLEGPAHSAGIRQGDELLAVNGVDVKGKSAFEASSMLQGPSETFVDVTVKHGNCGSVQSVKVQRQSVAKSPVFYRLEQVKNGPSSVGYVRLKEFNALARKDLVTAMRRLQDMGASYFVLDLRDNLGGLVQAGIEIAKLFLDKGETVTYTVGRDPQSVKNIVAESSSLFSAPVIVLVNKNTASASEIVATALHDNCKAVLVGERTYGKGLIQSVFELNDGSGVVVTVGKYV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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