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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000524`

染色体: Chr05 坐标: 4016728-4021234 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000524`
名称	SmilChr05G000524
描述	uncharacterized SmilChr05G000524
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4016728 - 4021234 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985267`
GeneID	`130985267`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985267`
原始查询	`LOC130985267`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07468 (Agglutinin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985267

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057764131.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057764131.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764131.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764131.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4017279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:4017286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B14
`Chr5:4017318`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A20,B25,B35,B68,B88,C40
`Chr5:4017354`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	30	A14,A6,B105,B106,B107,B113,B126,B14,B2,B22,B42,B43,B51,B55,B62,B69,B70,B74,B76,B88,C2,C27,C28,C34,C45,C54,C62,C71,D5,D6
`Chr5:4017355`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	30	A14,A6,B105,B106,B107,B113,B126,B14,B2,B22,B42,B43,B51,B55,B62,B69,B70,B74,B76,B88,C2,C27,C28,C34,C45,C54,C62,C71,D5,D6
`Chr5:4017410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C8
`Chr5:4017439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B24,B93,C33,C78
`Chr5:4017459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B89,C19,C38,C51
`Chr5:4017469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B24,B93,C33,C78
`Chr5:4017495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A20,B138,B30,B51,C59
`Chr5:4017495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B138,B30,B51,C59
`Chr5:4018119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B124,B54,B94,B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764131.1

459 aa

230

459

Agglutinin

PF07468 Agglutinin 43-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764131.1`	Pfam	`PF07468`	Agglutinin	Domain	43	118	8.2e-15	56.0	Agglutinin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908148.1
GGGGTCTTGGACGAAGTAGCCCCTCAAATGTATCTATAAATACAGTTGGAGAAAACACCATCTGATCAAATCAAAATCATTTCTTCAACTCAATATCGGCTCTTCTTTGTTTGAAATATGGCAAGTTTGGCGGTAGACGCAATTCCAAGGTTCATCGTGATCAAGTCAAAAGTTTATAGTGATAAAGGCAATGCATACTTCAAGGCAGAGGGTACTGGTGGGTCCATACTTCTCGGTGAAGCCGACATGTTCAGCACGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985267
ATGGCAAGTTTGGCGGTAGACGCAATTCCAAGGTTCATCGTGATCAAGTCAAAAGTTTATAGTGATAAAGGCAATGCATACTTCAAGGCAGAGGGTACTGGTGGGTCCATACTTCTCGGTGAAGCCGACATGTTCAGCACGCTTGTGAAGATCGAGGCTGAGCGATCAAAAAGCAGCAATAACTACATCAACCTCCGATTTTGTTATTCCAATAGATATTGGGCGCGGAAGGCAGACAGCAACTTTATTGTGGCCGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764131.1
MASLAVDAIPRFIVIKSKVYSDKGNAYFKAEGTGGSILLGEADMFSTLVKIEAERSKSSNNYINLRFCYSNRYWARKADSNFIVADSDQPEEDTTKPTCTLFEAVKVDDFFYLIHVQSGGHLLMDSATLAFYVDSNSISEQAYLTFVDWNSLVKLPPRIAIKGDNEKYIKNFNGNLQFASDDANNEDSSYLVELRPNGNVQIRLAGNEDAYWSLSHTVNSWINMVDPFSEQNQFWPVKVDENSIALRSVDNNNFCRRLTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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