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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000606`

染色体: Chr05 坐标: 4570970-4573365 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000606`
名称	SmilChr05G000606
描述	heat stress transcription factor A-4c-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4570970 - 4573365 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985273`
GeneID	`130985273`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985273`
原始查询	`LOC130985273`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heat stress transcription factor A-4c-like
产物	heat stress transcription factor A-4c-like
Arabidopsis	`AT4G18880` (HSF A4A) heat shock transcription factor A4A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827622] identity=45.7; qcov=1.04; evalue=4.66e-100; confidence=high
Rice	`Os01g0749300` (HSFA4A) - identity=42.4; qcov=1.1; evalue=1.83e-102; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00447 (HSF_DNA-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985273

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764155.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764155.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764155.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764155.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764155.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4572227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C48
`Chr5:4572241`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A19
`Chr5:4572241`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A19
`Chr5:4572390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B36,C38,C77,C81
`Chr5:4572677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B102,C77
`Chr5:4572794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C78
`Chr5:4572816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B136,B77
`Chr5:4572940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr5:4572993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B24
`Chr5:4573089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:4573131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764155.1

399 aa

200

399

HSF_DNA-bind

PF00447 HSF_DNA-bind 15-104 aa

XP_057764156.1

399 aa

200

399

HSF_DNA-bind

PF00447 HSF_DNA-bind 15-104 aa

XP_057764157.1

399 aa

200

399

HSF_DNA-bind

PF00447 HSF_DNA-bind 15-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764155.1`	Pfam	`PF00447`	HSF_DNA-bind	Domain	15	104	4.1e-31	108.2	HSF-type DNA-binding
`XP_057764156.1`	Pfam	`PF00447`	HSF_DNA-bind	Domain	15	104	4.1e-31	108.2	HSF-type DNA-binding
`XP_057764157.1`	Pfam	`PF00447`	HSF_DNA-bind	Domain	15	104	4.1e-31	108.2	HSF-type DNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908172.1
AAGGATGATTGTTTATCAAGTAAAGGGAATTTCTGCAGAAGTGCTCCTAAATTCCGTCCAATGTGTAAACCCTAGAAAACCCCACCTCGATTTTGAAAAAATTCCAAAGTTCCCAATATATAAATCGACGCCAACCGACATGAACTAACCACGCGGCCGTTAAGAAATTGAAGGTATTGGATGGAACCGTATTGTTTCTTTATCAGGGTGTTGTTGCGGATAGGTTTGGATTGTTGCGTTTGACTTGTTATCGACTCAAG...

XM_057908174.1
AAGGATGATTGTTTATCAAGTAAAGGGAATTTCTGCAGAAGTGCTCCTAAATTCCGTCCAATGTGTAAACCCTAGAAAACCCCACCTCGATTTTGAAAAAATTCCAAAGTTCCCAATATATAAATCGACGCCAACCGACATGAACTAACCACGCGGCCGTTAAGAAATTGAAGGGTGTTGTTGCGGATAGGTTTGGATTGTTGCGTTTGACTTGTTATCGACTCAAGTTGCTGGAGAGATTGGACGTAGAGGGATTTGGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985273
ATGATGGATGAGGCTCCGTGTAGCTCTAACTCGGTGGCGCCTTTCCTTGCGAAGACTTATGAGATGGTGGATGATCCATCTACGGACTCGATTGTATCTTGGAGTCAGAGCAATACAAGTTTCATTGTGTGGAACCCTCCAGAGTTTTCCAGGGAGCTACTGCCCAGATACTTCAAGCACAACAATTTCTCCAGCTTTATTAGGCAGCTAAATACATATGGTTTCAGAAAAGTTGATCCCGAACAGTGGGAATTTGCGAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057764155.1
MMDEAPCSSNSVAPFLAKTYEMVDDPSTDSIVSWSQSNTSFIVWNPPEFSRELLPRYFKHNNFSSFIRQLNTYGFRKVDPEQWEFANEGFARGQLHLLKNIHRRKPVHSHSTPNLASLPPLTELERKGYKEDIERLKCEKESLDVELQRHKDKRQDLTLQMRALAERAQNVEQHHASMLSSLAETLHQPDLMPQMEVHDRKRRFPGNSYMCEGTSTEDCQRPSSQNLSIDSLDADALLTFNKELLDQIDSSMSLWEKMIL...

XP_057764156.1
MMDEAPCSSNSVAPFLAKTYEMVDDPSTDSIVSWSQSNTSFIVWNPPEFSRELLPRYFKHNNFSSFIRQLNTYGFRKVDPEQWEFANEGFARGQLHLLKNIHRRKPVHSHSTPNLASLPPLTELERKGYKEDIERLKCEKESLDVELQRHKDKRQDLTLQMRALAERAQNVEQHHASMLSSLAETLHQPDLMPQMEVHDRKRRFPGNSYMCEGTSTEDCQRPSSQNLSIDSLDADALLTFNKELLDQIDSSMSLWEKMIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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