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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000500`

染色体: Chr05 坐标: 3905454-3909765 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000500`
名称	SmilChr05G000500
描述	la-related protein 6A
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3905454 - 3909765 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985280`
GeneID	`130985280`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985280`
原始查询	`LOC130985280`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	la-related protein 6A
产物	la-related protein 6A
Arabidopsis	`AT5G46250` (LARP6a) RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834667] identity=52.4; qcov=0.967; evalue=3.77e-113; confidence=high
Rice	`Os08g0542900` - identity=39.1; qcov=0.891; evalue=1.91e-56; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005844 (GO:0005844); GO:0006396 (RNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF05383 (La)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985280

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057764165.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057764165.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057764165.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057764165.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057764165.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3905902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C27,D11
`Chr5:3905909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B5
`Chr5:3907150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B36,C39,D4
`Chr5:3907222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C50
`Chr5:3907442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,D3
`Chr5:3907460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B98,C55
`Chr5:3907827`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A16,B104,B105,B24,B25,B26,B36,B48,B98,C12,C27,C39,C50,C53,C55,C65,C7,C76,D1,D11,D4
`Chr5:3908435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C50,C65
`Chr5:3908573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr5:3908586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:3908683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:3908710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B27,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764165.1

367 aa

184

367

PF05383 La 62-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764165.1`	Pfam	`PF05383`	La	Domain	62	120	1.7e-26	92.6	La domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908182.1
ATGCATTTCTTTTTTAGTTTTCACCAAAAAAAAAAAAAGAACTTGGAAATGCATTCCAGACTTTTTAAAAAAAGTTGAATTTCTTTGATAATTATTTTCCTCTTCCGTGTCGTGAAATATTTTTAATTTATTATTATTTTTTATTATTAACTGCGCGCACGTGTTAAAATATGGAAATATTTCACCGTATATTTAACCATTGGAAGCGAGAAGCATTTCTTCGAGAGATCGAGAGAGAGAAGAAAAGAGGGGCAAAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985280
ATGGAACAACCGGCCCTCCACTTCCCCGCCGCCTCATCTCCGCCGTCCGATAATGAATTTGACCACGACGAGGATCACCACGATTTCTCCCCCGTCGGCTCACCGGAGCTCACCGAATCTCATTTCCCGCCGCCGTCGGATCAGCCGCAGCCTTCCGTGCTCTCCGATGATCTCCGCCGCAAGATCATCAAGCAGGTGGAGTATTACTTCAGTGATGAAAATTTGCCAAATGACAAGTTTATGCTGAAGTATGTAACAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764165.1
MEQPALHFPAASSPPSDNEFDHDEDHHDFSPVGSPELTESHFPPPSDQPQPSVLSDDLRRKIIKQVEYYFSDENLPNDKFMLKYVTRNPEGFVPIGVVASFKKMKKLTRDASLIVAALKESTFLVVSSNEKKVKRLHPLPLADKDPMVCTVLVENLPEDHSVENLHRVFGEAGIIKNITIRDPHDARDPKKCTIAEKLISGKLHALVEYDTVEAAEKAVATLNNEQDWRYGLRVKLLKKTNKPGQKKKVWRELEPDKGST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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