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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002632`

染色体: Chr01 坐标: 44615318-44617660 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002632`
名称	SmilChr01G002632
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 47A
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44615318 - 44617660 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985288`
GeneID	`130985288`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985288`
原始查询	`LOC130985288`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 47A
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 47A
Arabidopsis	`AT1G12770` (EMB1586) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837833] identity=58.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0636300` (OsRH47A) - identity=68.4; qcov=0.841; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985288

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057764178.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764178.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764178.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764178.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764178.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44616336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr1:44616363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C32,C68
`Chr1:44616770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A2,B132,B4,C36
`Chr1:44616933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:44616964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B126,B61,B65
`Chr1:44617352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764178.1

558 aa

279

558

ResIII

DEAD

Helicase_C

PF04851 ResIII 137-279 aa PF00270 DEAD 137-327 aa PF00271 Helicase_C 399-507 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764178.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	137	279	1.4e-07	32.3	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057764178.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	137	327	1.4e-39	136.3	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057764178.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	399	507	1.7e-25	90.1	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908195.1
TAGAGGTAGAAATGCAATTATCAAAGCTCAATGTCCTTGGCCTCAATTGGCTACAAAAGTTGATCCTTATCTTCTAATTCCACAAATTTGAAAGGGCTCAGCTGCAAATTACTCGAAAAATATTGTGTTTTCATCCGTCCATTCACCCCTTCTCTGCTGCCGCCATTTCTATCGTCATCTACGTAAGCGCTGTCTCTCTCTCACACACAGGTGCCCTCGAACGCCTTCACCCACGCACTCTGATTCCTTTGCTAGGCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985288
ATGCCTGCTTTAGCTGCAAGTAGGCTGCTTCTTCTTGTTGGCGACGCCATATCATCAGGGAAATCTTGTGTGTTTTCACGTGTAAGTCCTCGATACAGCAGCGTGCGTCGATATAGTCGTGTTAGTAGCGAGAACAGCAAGTCTCTCACCCTAAAGAGTCTTGGATTCAAGAGTGAAGTTCTGAGGAGTGATGGAAATGATAAAAACAAACTCAGTAAGGGGATTTCCACAATCGAGGTCCCTAAAAATAGAGAGAGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764178.1
MPALAASRLLLLVGDAISSGKSCVFSRVSPRYSSVRRYSRVSSENSKSLTLKSLGFKSEVLRSDGNDKNKLSKGISTIEVPKNRERKGIPREANAVKKKERVDVAALAPFAAQSFSELGLPPLLVERLEKEGYNVPTDVQAAAVPTILKEHDVVIQSYTGSGKTLAYVLPILSEVGPFKGDDERRSKMGVQAVVLAPSRELGMQIVREVEKLLGPEDKRLVQQLVGGANKSRQEEALKKNKPVIVVGTPGRIAEISASGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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