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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000509`

染色体: Chr05 坐标: 3933757-3935691 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000509`
名称	SmilChr05G000509
描述	uncharacterized protein At2g34460, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3933757 - 3935691 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985310`
GeneID	`130985310`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985310`
原始查询	`LOC130985310`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818009]; symbol=AT2G34460; hit=AT2G34460; species=arabidopsis; confidence=high
产物	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818009]; symbol=AT2G34460; hit=AT2G34460; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G34460` (AT2G34460) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818009] identity=71.7; qcov=0.976; evalue=1.14e-143; confidence=high
Rice	`Os06g0360300` - identity=62.3; qcov=1.01; evalue=4.07e-120; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF05368 (NmrA); PF13460 (NAD_binding_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985310

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764208.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057764208.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057764208.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057764208.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057764208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3933847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B17,B40,C49,D7
`Chr5:3934078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:3934100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B14
`Chr5:3934455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B14
`Chr5:3935104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,D3
`Chr5:3935227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:3935230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C49,C83
`Chr5:3935503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764208.1

290 aa

145

290

NmrA

Epimerase

3Beta_HSD

NAD_binding_10

PF05368 NmrA 55-217 aa PF01370 Epimerase 58-219 aa PF01073 3Beta_HSD 60-177 aa PF13460 NAD_binding_10 62-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764208.1`	Pfam	`PF05368`	NmrA	Family	55	217	1.2e-14	55.4	NmrA-like family
`XP_057764208.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	58	219	4.6e-12	46.6	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057764208.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	60	177	4.8e-08	33.1	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057764208.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	62	259	4.4e-47	161.1	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908225.1
GACAAAAGAATTGCGTAAATGAAAATTTATTATATGAATTATTTGCAAATTTAGCGATGTATCGCGAAGCCACGAATATATTTTAACGTTCCTACTATAATTGTGGCGGGTATCATTTCGTAGCCCAAATTATTTTTTATTATTTGAAATTAAAAAGACAAAAATAGGCCAATGGCAATGGCTGCAGCCTCAGCTGCATCTGCTGCTCTCTTCCTCAGAACTTCTCTATTCCACTCCTTCTCTTTCACCACCAGACCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985310
ATGGCAATGGCTGCAGCCTCAGCTGCATCTGCTGCTCTCTTCCTCAGAACTTCTCTATTCCACTCCTTCTCTTTCACCACCAGACCCCACTCTCTCTTCGTCAAAGCTTCATCTATGGAGGGAGGCGAGATTAAGGAGGAATCGAACGAGCGCGCTATTGAGAGAAAGAAGATATTCGTTGCCGGCGCAACTGGAAGTACGGGGAAGAGGATCGTGGAGCAGCTTCTGGCGAAGGGATTTGCTGTTAAAGCTGGTGTAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764208.1
MAMAAASAASAALFLRTSLFHSFSFTTRPHSLFVKASSMEGGEIKEESNERAIERKKIFVAGATGSTGKRIVEQLLAKGFAVKAGVRDLEKAKSAFPGNNPDLQIVKADVTEGSDKLAEAISDDSDAVICATGFRPGWDLFAPWKVDNFGTVNLVEACRKQNVNRFILVSSILVNGAAMGQLLNPAYIFLNVFGLTLVAKLQAEQHIRKSGIDYTIIRPGGLKNDPPKGNIVMEPEDTLYEGSISRDQVAEVAVEALLNS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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