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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000574`

染色体: Chr05 坐标: 4315863-4318154 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000574`
名称	SmilChr05G000574
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g18975, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4315863 - 4318154 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985312`
GeneID	`130985312`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985312`
原始查询	`LOC130985312`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g18975, chloroplastic-like
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g18975%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G18975` (AT4G18975) Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827633] identity=66.1; qcov=0.803; evalue=1.37e-106; confidence=high
Rice	`Os07g0545900` - identity=52.5; qcov=0.703; evalue=7.01e-63; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985312

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764211.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057764211.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764211.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764211.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764211.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4316550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B125,B138,B56,B90,B92,B96,C39,D3
`Chr5:4316562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr5:4316757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:4316781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B110,B50,C50
`Chr5:4316989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr5:4317007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C20
`Chr5:4317081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B11,C27,C41,C71
`Chr5:4317083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B124,B94
`Chr5:4317083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B94
`Chr5:4317092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	58	A21,A24,B102,B104,B107,B112,B113,B119,B128,B133,B22,B26,B29,B3,B37,B38,B39,B42,B43,B49,B53,B58,B62,B68,B7,B71,B72,B83,B85,B88,B90,B92,C13,C15,C16,C24,C25,C26,C29,C3,C35,C38,C42,C45,C48,C5,C59,C63,C64,C66,C67,C77,C79,D10,D11,D4,D8,D9
`Chr5:4317097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B125,B138,B56,B82,B90,B92,C39,D3
`Chr5:4317492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908228.1
GCTGCAATTAATTCAATTCTTTGAGGAGAATGAATAATCAGTTGATAATTCTTGCTGCATTTCTACTTCTTCTCAATATCGTAGCTTCATCGGGTCAACGGCAGGTTATAGGTTTAATCTTGATTATCATCAATTAATTTGGCCCAAGTAAAGCTCTATCGATTACCGAAGGCCCAGATCATCGGCCCATGGGTTTTTTGTTGTTTACTCTGCTTTCCAAAATTACCATAGCCCATTAATACTATGTTTTCTCACTGAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985312
ATGAATTATTTGCAATTATCAAGTCGACAGGTTTTATTTGTTAAAGTAGATTTTCCTGTATTCAATTTGTTCCAGAGATACAATGTTTCCTCTCTCCTAATCAAGGCATCTGATTCCAGCGTTCCGACGTATAAGGCGATAGCTTCTCCGCAAGACTTCCGTGGAGGCCAAAATGATAAATCTTTGGTTACATCAAATGCTGTTGAGAAAAAACTTGTTCGGAAGTCGGGAAAGAAGGAGCACCACTTATGGAAAAGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764211.1
MNYLQLSSRQVLFVKVDFPVFNLFQRYNVSSLLIKASDSSVPTYKAIASPQDFRGGQNDKSLVTSNAVEKKLVRKSGKKEHHLWKRRDQIGSGHKALNLVRTICGLANEKEAVYSALDEWIAWETEFPLIAAAKALVILRQRSQWKRIIQVAKWMLSKGQGATMATYDHLLLAFDMDRRPDEAEMLWNMILHAHDRSISKRLFSRMISLYDHHNMANNVIEVFADMEELGVKPDEDTVRRIARAFEVLGQEDKQKQFLTK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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