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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000602`

染色体: Chr05 坐标: 4531464-4533916 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000602`
名称	SmilChr05G000602
描述	aquaporin NIP1-1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4531464 - 4533916 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985314`
GeneID	`130985314`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985314`
原始查询	`LOC130985314`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aquaporin NIP1-1-like
产物	aquaporin NIP1-1-like
Arabidopsis	`AT4G18910` (NIP1;2) NOD26-like intrinsic protein 1;2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827626] identity=70.8; qcov=1; evalue=2.23e-122; confidence=high
Rice	`Os02g0232900` (OsNIP1) - identity=74.2; qcov=0.97; evalue=2.12e-121; confidence=high
GO	GO:0015267 (channel activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985314

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057764214.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057764214.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057764214.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057764215.1`
5	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.20000	`XP_057764215.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4531588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr5:4531613`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A8,B102,B105,B111,B114,B129,B22,B45,B74,B77,B91,C15,C19,C3,C38,C4,C52,C84,C9
`Chr5:4531642`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A22,A24,B106,B132,B139,B17,B21,B44,B96,C16,C41,C74,C86,C87,D3
`Chr5:4531672`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	B11,B130,B133,B25,B32,B46,B82,C50,C65,D7
`Chr5:4531673`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B11,B130,B133,B25,B32,B46,B82,C50,C65,D7
`Chr5:4533431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr5:4533500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C47
`Chr5:4533501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B62
`Chr5:4533792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B135,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764214.1

270 aa

135

270

MIP

PF00230 MIP 30-241 aa

XP_057764215.1

236 aa

118

236

MIP

PF00230 MIP 2-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764214.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	30	241	1.6e-64	218.4	Major intrinsic protein
`XP_057764215.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	2	207	1e-62	212.5	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908231.1
CTATAAGAAAATTAATGGAACAATATTTATGAGAAACACCTTAGCCCTCTATATAGATATACAGTTGTTTGTAATCAAAGAATTATGGGTGATGAGATATTATCCGGTGCAAATGTGAACGAGGGAGTGGATGCTCATGATTCCAATCACTCTTCAAGATGCTGCTCTCTCACTGTCTCATTTATACAAAAGTTAATAGCGGAGACGCTGGGGACATTCTTCTTGATATTCGCCGGTTGCGGCGCCGTGGCGGTGAACGC...

XM_057908232.1
ATGCAGTTAATAGCGGAGACGCTGGGGACATTCTTCTTGATATTCGCCGGTTGCGGCGCCGTGGCGGTGAACGCCGACAAGGAGAAGGTGATAACGCTGCCCGGAATAGCCATAGTGTGGGGCCTGGTGGTGATGGTCATGGTTTACTCCGTCGGCCACATCTCCGGCGCCCACTTCAACCCCGCCGTCACCATCGCCTTCGCCTCCATCAACAGGTTCTCTTGGAAACAGGTACCTGCGTATGTGGCGGCTCAAGTAGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985314
ATGGGTGATGAGATATTATCCGGTGCAAATGTGAACGAGGGAGTGGATGCTCATGATTCCAATCACTCTTCAAGATGCTGCTCTCTCACTGTCTCATTTATACAAAAGTTAATAGCGGAGACGCTGGGGACATTCTTCTTGATATTCGCCGGTTGCGGCGCCGTGGCGGTGAACGCCGACAAGGAGAAGGTGATAACGCTGCCCGGAATAGCCATAGTGTGGGGCCTGGTGGTGATGGTCATGGTTTACTCCGTCGGCCA...

LOC130985314
ATGCAGTTAATAGCGGAGACGCTGGGGACATTCTTCTTGATATTCGCCGGTTGCGGCGCCGTGGCGGTGAACGCCGACAAGGAGAAGGTGATAACGCTGCCCGGAATAGCCATAGTGTGGGGCCTGGTGGTGATGGTCATGGTTTACTCCGTCGGCCACATCTCCGGCGCCCACTTCAACCCCGCCGTCACCATCGCCTTCGCCTCCATCAACAGGTTCTCTTGGAAACAGGTACCTGCGTATGTGGCGGCTCAAGTAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764214.1
MGDEILSGANVNEGVDAHDSNHSSRCCSLTVSFIQKLIAETLGTFFLIFAGCGAVAVNADKEKVITLPGIAIVWGLVVMVMVYSVGHISGAHFNPAVTIAFASINRFSWKQVPAYVAAQVVGSTVAAGTLRLLFSGSHDHFVGTLPAGTDLQSLALEFIITFYLMFVISGVATDNRAIGELAGMAIGATVSINVLFAGPISGASLNPARSLGPAIVSKNYRGLWIYLLGPTAGAIAGAWAYNLIRFTNKPLREITKTVSF...

XP_057764215.1
MQLIAETLGTFFLIFAGCGAVAVNADKEKVITLPGIAIVWGLVVMVMVYSVGHISGAHFNPAVTIAFASINRFSWKQVPAYVAAQVVGSTVAAGTLRLLFSGSHDHFVGTLPAGTDLQSLALEFIITFYLMFVISGVATDNRAIGELAGMAIGATVSINVLFAGPISGASLNPARSLGPAIVSKNYRGLWIYLLGPTAGAIAGAWAYNLIRFTNKPLREITKTVSFLRSEAHIRAP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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