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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000566`

染色体: Chr05 坐标: 4254256-4256838 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000566`
名称	SmilChr05G000566
描述	eukaryotic translation initiation factor 4E-2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4254256 - 4256838 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985324`
GeneID	`130985324`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985324`
原始查询	`LOC130985324`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 4E-2-like
产物	eukaryotic translation initiation factor 4E-2-like
Arabidopsis	`AT4G18040` (EIF4E) eukaryotic translation initiation factor 4E [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827529] identity=77.5; qcov=0.764; evalue=3.92e-109; confidence=high
Rice	`Os01g0970400` (p26) - identity=78.6; qcov=0.863; evalue=9.47e-115; confidence=high
GO	GO:0000340 (RNA 7-methylguanosine cap binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006413 (translational initiation); GO:0016281 (eukaryotic translation initiation factor 4F complex)
KEGG	-
Pfam	PF01652 (IF4E)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985324

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764235.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057764236.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057764235.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764235.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764235.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4254340`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B82
`Chr5:4254340`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B82
`Chr5:4254426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B26,C74
`Chr5:4256502`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	95	A1,A11,A21,A22,A25,A4,A7,A8,A9,B1,B106,B109,B119,B120,B122,B124,B126,B13,B130,B132,B135,B137,B139,B14,B140,B15,B18,B19,B23,B33,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B45,B49,B50,B53,B57,B58,B60,B61,B64,B65,B66,B67,B7,B72,B74,B77,B78,B79,B8,B81,B85,B86,B9,B90,B92,B97,B99,C20,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C32,C37,C39,C41,C42,C43,C45,C46,C47,C52,C6,C60,C61,C67,C68,C70,C71,C73,C76,C8,C80,C9,D1,D10,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764235.1

237 aa

118

237

IF4E

PF01652 IF4E 59-217 aa

XP_057764236.1

233 aa

116

233

IF4E

PF01652 IF4E 59-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764235.1`	Pfam	`PF01652`	IF4E	Domain	59	217	6.4e-62	209.0	Eukaryotic initiation factor 4E
`XP_057764236.1`	Pfam	`PF01652`	IF4E	Domain	59	229	7.9e-64	215.2	Eukaryotic initiation factor 4E

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908253.1
GACAAAACCCCAGCTCTCGTTTCCACTTCACATCCCAAAACACAAATCTGCAGAAATTAGCGAGGAAGGAAAACGATGGTTGAAGAAAGCGAGAAATCCGCGGCTGCCGCCATCAATGATGAACTAGAGAACTCATCTGAGATGAACAAGAATCACCACGGTGAGGACTCGGAGATGGAGGAAGGGGAGATCATCGCCGCCGATTCCGACGCCGCCGCGAAAGCCATGGAGCCTCCGCCGCCGAGACATCCCTTGGAACA...

XM_057908252.1
AACCCCAGCTCTCGTTTCCACTTCACATCCCAAAACACAAATCTGCAGAAATTAGCGAGGAAGGAAAACGATGGTTGAAGAAAGCGAGAAATCCGCGGCTGCCGCCATCAATGATGAACTAGAGAACTCATCTGAGATGAACAAGAATCACCACGGTGAGGACTCGGAGATGGAGGAAGGGGAGATCATCGCCGCCGATTCCGACGCCGCCGCGAAAGCCATGGAGCCTCCGCCGCCGAGACATCCCTTGGAACATTCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985324
ATGGTTGAAGAAAGCGAGAAATCCGCGGCTGCCGCCATCAATGATGAACTAGAGAACTCATCTGAGATGAACAAGAATCACCACGGTGAGGACTCGGAGATGGAGGAAGGGGAGATCATCGCCGCCGATTCCGACGCCGCCGCGAAAGCCATGGAGCCTCCGCCGCCGAGACATCCCTTGGAACATTCCTGGACATTCTGGTTCGATAATCCGTCCGCAAAATCGAAACAGGCGGCGTGGGGAAGCTCAATTCGCCCGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764235.1
MVEESEKSAAAAINDELENSSEMNKNHHGEDSEMEEGEIIAADSDAAAKAMEPPPPRHPLEHSWTFWFDNPSAKSKQAAWGSSIRPIYTFSTVEDFWSVYNNIHHPSKLAVGADFHCFKHKIEPKWEDPICANGGKWTVTYSRGKSDTCWLYTLLAMIGEQFDYGDEICGAVVNVRARQEKIAIWTKNAANEAAQLSIGKQWKELLDYNETIGYIFHVSFPFSHVDANLLCQFSSDR

XP_057764236.1
MVEESEKSAAAAINDELENSSEMNKNHHGEDSEMEEGEIIAADSDAAAKAMEPPPPRHPLEHSWTFWFDNPSAKSKQAAWGSSIRPIYTFSTVEDFWSVYNNIHHPSKLAVGADFHCFKHKIEPKWEDPICANGGKWTVTYSRGKSDTCWLYTLLAMIGEQFDYGDEICGAVVNVRARQEKIAIWTKNAANEAAQLSIGKQWKELLDYNETIGYIFHDDAKKLDRGAKNRYTV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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