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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000613`

染色体: Chr05 坐标: 4610292-4612813 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000613`
名称	SmilChr05G000613
描述	ER lumen protein-retaining receptor A
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4610292 - 4612813 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985331`
GeneID	`130985331`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985331`
原始查询	`LOC130985331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ER lumen protein-retaining receptor A
产物	ER lumen protein-retaining receptor A
Arabidopsis	`AT1G29330` (ERD2) ER lumen protein retaining receptor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839807] identity=82.3; qcov=1; evalue=1.02e-136; confidence=high
Rice	`Os05g0529300` - identity=77.2; qcov=1; evalue=3.95e-124; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005801 (cis-Golgi network); GO:0006621 (protein retention in ER lumen); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0016020 (membrane); GO:0046923 (ER lumen protein retrieval receptor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00810 (ER_lumen_recept)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985331

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057764246.1`
2	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057764246.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057764246.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057764246.1`
5	Cis-golgi network	Cis-golgi network	0.60000	`XP_057764246.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4611159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B128,B2
`Chr5:4611206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:4611315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B136,B57,B66
`Chr5:4611396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C23
`Chr5:4611702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:4612205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B58
`Chr5:4612228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B25,C11,D7
`Chr5:4612229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B6,B88,C22
`Chr5:4612311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B125,B38,C13
`Chr5:4612320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr5:4612470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764246.1

215 aa

108

215

ER_lumen_recept

PF00810 ER_lumen_recept 28-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764246.1`	Pfam	`PF00810`	ER_lumen_recept	Repeat	28	171	1.4e-59	201.8	ER lumen protein retaining receptor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908263.1
TCACTTCTCGTCTCGTCTCGTCTCGTCTCCAATTTTTCAATTACGAGTATTTTTCTTTGCGTAAAAGTTTAAACTCCAAAACCTCCCTCACCTCTTCATTCTTTTCCCTTTCTGCCAAAAAACAATAAAGAAAAAAAAAACATAAAAAGGAAGAAGGAAGAAAAAAATTTCGAACTCTAAGAACTTCGCAACGATGAATGTTTTCAGATTTATTGGTGATATGACGCATTTGGTCAGCATTTTAGTGCTTCTCCTCAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985331
ATGAATGTTTTCAGATTTATTGGTGATATGACGCATTTGGTCAGCATTTTAGTGCTTCTCCTCAAAATCTATGCGACCAAATCGTGTTCAGGGATTTCCTTAAAGACTCAGGAACTGTATGCAATTGTCTTCTTGACTCGGTACCTTGATTTGTTTACTGACTTCATCTCCGTGTATAATGCCATAATGAAAGTGGTGTTCATTGCAAGCTCTTTGGCGATTGTTTGGTATATGAGGTTTCACCCAGTAATTAGACGATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764246.1
MNVFRFIGDMTHLVSILVLLLKIYATKSCSGISLKTQELYAIVFLTRYLDLFTDFISVYNAIMKVVFIASSLAIVWYMRFHPVIRRSYDRELDTFRHYFLVGACFLLALFVNEKFSFEEVFWAFSIYLEAVAILPQLVLLQRSGNVDNLAGQYVFFLGAYRAFYILNWIYRYFTEDHFTRWIACVSGLVQTALYADFFYYYFISWKNNSKLKLPA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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