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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000504`

染色体: Chr05 坐标: 3921327-3926190 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000504`
名称	SmilChr05G000504
描述	60S ribosomal protein L18a-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3921327 - 3926190 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985333`
GeneID	`130985333`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985333`
原始查询	`LOC130985333`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L18a-like
产物	60S ribosomal protein L18a-like
Arabidopsis	`AT1G29970` (RPL18AA) 60S ribosomal protein L18A-1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839876] identity=70.4; qcov=0.936; evalue=2.73e-150; confidence=high
Rice	`Os01g0752300` (RPL18A) - identity=89.2; qcov=0.561; evalue=3.56e-114; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01775 (Ribosomal_L18A)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985333

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764249.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057764248.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057764248.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057764249.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764248.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3921598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,C33,C61
`Chr5:3921610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C33,D10
`Chr5:3921612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:3921614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C33
`Chr5:3921618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,D10
`Chr5:3921651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B52
`Chr5:3921679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B91,C26,C8
`Chr5:3921750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr5:3924787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C9
`Chr5:3925751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:3925778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B12,C38,C61
`Chr5:3925855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764248.1

178 aa

178

Ribosomal_L18A

PF01775 Ribosomal_L18A 7-128 aa

XP_057764249.1

314 aa

157

314

Ribosomal_L18A

PF01775 Ribosomal_L18A 143-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764248.1`	Pfam	`PF01775`	Ribosomal_L18A	Domain	7	128	1.6e-23	83.5	Ribosomal proteins 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A
`XP_057764249.1`	Pfam	`PF01775`	Ribosomal_L18A	Domain	143	264	6e-23	81.6	Ribosomal proteins 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908266.1
AGTGCGTGTTTGTGTGGAAAGAAAAATGAAAATAAAAATTGATAAATAAATGAAATAAAGAGGCGGCCACCTCAGAATAACGCGGCAAAGGGTAAGGCGCCAGCAGCCTTTCGGAGTCGGAATCAATCAAATCTCAATCGATCGACGACACCACCAATTTCCGGGAGCCGGAACCCTAGCACCGCGATCCCATCACCGCTTTCGTCTAATTCCGGCAACAATGAGCGAAGAAGGCGGAGGAAAGAACCCAGGCGTCTCGG...

XM_057908265.1
TGAGGGTGCAGATGGGCCGGCAGCCAGTAACTTAAAAAAGAGGGCTCAATAAGAAAATTGGCCCATGAAACAAATTAGGGTTTCTGAGAGGCTAAATTCTCGATCTTTAATCACAAAAACCCCCTTCACACACCTTTCACCTGCCCGCACTCTCCTCCACAAAGGGAACGCTGCGATTATTTCCAACACCGCCGGAAAATGGTGACATACAGGTTCCATCAGTACCAGGTGGTGGGGAGAGCTCTGCCGACGGAGACGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985333
ATGAGCGAAGAAGGCGGAGGAAAGAACCCAGGCGTCTCGGCCGCCGCCGCCGCCCAATCTTCGCCGCCGCCGCCGAATTATTACTACGGCACTTTTCAAGGCGTGGCTAACTATCAGCCCCAGCCTCTGCCGCCCGATTATTCGGTGGTGGGTATCCCTCAGCCTGCGCCGCCTCCCGCCATCTCTGGCTCGCTGCCGCGTTACTATCCACAGGGATATCACACCGTTACCGGTCATGTTGTTGCTCATGGACGACCTTT...

LOC130985333
ATGGTGACATACAGGTTCCATCAGTACCAGGTGGTGGGGAGAGCTCTGCCGACGGAGACGGAGGAGCACCCGAAGATCTACCGCATGAAGCTCTGGGCCACAAATGAAGTCCGCGCTAAGTCCAAATTCTGGTATTTCTTGAGGAAGCTCAAGAAGGTGAAAAAGAGCAACGGGCAGGTTCTTGCTATCAATGAGATTTTTGAGAAAAACCCTACAACCATCAAGAACTACGGGATCTGGTTGAGATACCAGAGCAGAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764248.1
MVTYRFHQYQVVGRALPTETEEHPKIYRMKLWATNEVRAKSKFWYFLRKLKKVKKSNGQVLAINEIFEKNPTTIKNYGIWLRYQSRTGYHNMYKEYRDTTLNGGVEQMYTEMASRHRVRSHCIQIIKTATVPAKLCKRESTKQFHDSKIKFPLVYKKVRPPSRKLKTTYKATRPNLFM

XP_057764249.1
MSEEGGGKNPGVSAAAAAQSSPPPPNYYYGTFQGVANYQPQPLPPDYSVVGIPQPAPPPAISGSLPRYYPQGYHTVTGHVVAHGRPFREERLPCCGVGLGWLLFITGFFLGAIPWYIGAFLLLCVRMDYREKPGLVACAIAFHQYQVVGRALPTETEEHPKIYRMKLWATNEVRAKSKFWYFLRKLKKVKKSNGQVLAINEIFEKNPTTIKNYGIWLRYQSRTGYHNMYKEYRDTTLNGGVEQMYTEMASRHRVRSHCIQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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