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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000559`

染色体: Chr05 坐标: 4204943-4206202 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000559`
名称	SmilChr05G000559
描述	oxoglutarate-dependent flavonoid 7-O-demethylase 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4204943 - 4206202 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985347`
GeneID	`130985347`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985347`
原始查询	`LOC130985347`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oxoglutarate-dependent flavonoid 7-O-demethylase 1-like
产物	oxoglutarate-dependent flavonoid 7-O-demethylase 1-like
Arabidopsis	`AT1G17020` (SRG1) senescence-related 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838272] identity=51.4; qcov=0.805; evalue=1.09e-19; confidence=low
Rice	`Os03g0439500` - identity=41.4; qcov=0.805; evalue=2.62e-14; confidence=low
GO	GO:0051213 (dioxygenase activity)
KEGG	-
Pfam	PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985347

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764268.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057764268.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764268.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764268.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764268.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4205689`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	135	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A20,A21,A23,A3,A4,A7,A8,B10,B100,B102,B104,B106,B110,B111,B113,B117,B120,B122,B123,B125,B126,B127,B13,B131,B132,B133,B14,B140,B15,B16,B17,B2,B21,B22,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B38,B39,B45,B48,B49,B52,B53,B54,B55,B6,B60,B61,B62,B64,B66,B67,B7,B73,B74,B77,B8,B85,B86,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B97,B98,C1,C10,C13,C16,C20,C21,C23,C24,C26,C30,C31,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C46,C48,C49,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C60,C62,C63,C67,C7,C72,C73,C76,C77,C78,C81,C83,C84,C85,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D9
`Chr5:4205726`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B55
`Chr5:4205726`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B55
`Chr5:4205740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:4205750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B61,B63,B8,C73
`Chr5:4205773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B61,B63,B8,C73
`Chr5:4205801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B112,B71,B75,C62
`Chr5:4205836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B68
`Chr5:4205840`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B66
`Chr5:4205840`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B66
`Chr5:4205988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr5:4206008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764268.1

87 aa

DIOX_N

PF14226 DIOX_N 6-76 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764268.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	6	76	1.1e-18	68.7	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908285.1
TAGAGAGAGAGAGAATCAAAGGCGCAGATATTAGGCAGATCACTGAAGGTGCCAATTGTGCAAGAGCTTGCAAAGGAGAAACTGAGCAGTGTACCGTCAAGATCGAGATACATCCGACCCGATCACCAACATCTCACCGCCGCCGATGTTTCCTCCCTACCTCAAATCCCCGTCATCGATATGCAGAAGCTGCTCCTCTCAGATTCCATGGATTCCGAGCTTCACAGGCTGTACGAAGCTTGCCTAGATTGGGGTTTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985347
ATGCAGAAGCTGCTCCTCTCAGATTCCATGGATTCCGAGCTTCACAGGCTGTACGAAGCTTGCCTAGATTGGGGTTTCTTCCAGTTGATCAACCACGGCGTGGATGCGGCGCCCATAGCCAAAATGAGGTCGGAAATGACGGCGTTCTTCAACCTCCCGCCGGAAGAGAAGGACGTATTCCGGCAGAAGGAAGACGACGTCGAAGGGTATTTCCTACCACTTGATCAACACATGCACGCAGGGTTTCATTTTAAATGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764268.1
MQKLLLSDSMDSELHRLYEACLDWGFFQLINHGVDAAPIAKMRSEMTAFFNLPPEEKDVFRQKEDDVEGYFLPLDQHMHAGFHFKCD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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