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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000656`

染色体: Chr05 坐标: 4942157-4943351 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000656`
名称	SmilChr05G000656
描述	50S ribosomal protein L34, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4942157 - 4943351 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985371`
GeneID	`130985371`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985371`
原始查询	`LOC130985371`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L34, chloroplastic-like
产物	50S ribosomal protein L34%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G29070` (AT1G29070) Ribosomal protein L34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839781] identity=67.3; qcov=0.539; evalue=3.58e-36; confidence=medium
Rice	`Os01g0805000` - identity=60; qcov=0.492; evalue=5.12e-26; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005762 (mitochondrial large ribosomal subunit); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00468 (Ribosomal_L34)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985371

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764299.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764299.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764299.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764299.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764299.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4942533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr5:4942789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B84,C24
`Chr5:4942824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:4943013`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	A23,A3,A5,B105,B109,B110,B113,B114,B117,B13,B139,B34,B40,B6,B65,B88,C19,C29,C33,C42,C5,C57,C67,C8,C83
`Chr5:4943050`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B122,B131,B21,B41
`Chr5:4943050`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B122,B131,B21,B41
`Chr5:4943100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764299.1

193 aa

193

Ribosomal_L34

PF00468 Ribosomal_L34 151-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764299.1`	Pfam	`PF00468`	Ribosomal_L34	Family	151	182	5.4e-12	46.2	Ribosomal protein L34

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908316.1
GTGAGCCATCTGATATGACATGATTGACATAATTTTAAAAAATATTCATGAGTCAATTTTATTTTATTTTTTGATCAATTTGAGTTTTTCTTATTTTATTTCATGGAAGCATGACATTAAGTAGTCAAAGTTTAGGCTCAATCCAAAGTGAGGCCCATATGAATAGGCCTAGGATCTTAAAGTAGGCCCAATATATTATTCCAAGAAGCCCATTGTACATTGAAAGGCATAACAAAGCCCATGACAATTTTGTTATCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985371
ATGACAATTTTGTTATCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAATTGAAGATAAGGAAGCGGAAACCCTGAATAAGGATAACAAGATCGAAGGCAGGCAGCAGGGAGCGAGAAATCAAGGGGAAGAAATGGCGTCCTGCTTTTCAGTGGGTTCAAGTCTGTGTTACAGAGGGAATAATTTCAGCGCACCTTCAGCTTCACTTTCATTAGGTTCTAGAACAGCTACTTCTCTTTCTCTGAAGGCGAAACCTAAGGCGCAGATTTGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764299.1
MTILLSQKKKKKIEDKEAETLNKDNKIEGRQQGARNQGEEMASCFSVGSSLCYRGNNFSAPSASLSLGSRTATSLSLKAKPKAQICSGTLHSAFTPSSLSLSSASSFSGLSLGLCLNGAIGRGSDKRRGLVVRASKYLLCQTKRNRSRKSLARTHGFRKRMSSTSGRALIKRRRAKGRWKLCTKTNPSSGKRA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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