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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000683`

染色体: Chr05 坐标: 5191815-5194189 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000683`
名称	SmilChr05G000683
描述	uncharacterized SmilChr05G000683
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5191815 - 5194189 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985393`
GeneID	`130985393`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985393`
原始查询	`LOC130985393`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0242500; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0242500; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G18460` (AT4G18460) D-Tyr-tRNA(Tyr) deacylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827578] identity=79; qcov=0.62; evalue=1.27e-73; confidence=high
Rice	`Os01g0242500` - identity=80.6; qcov=0.62; evalue=4.78e-74; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006399 (tRNA metabolic process); GO:0051500 (D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02580 (Tyr_Deacylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985393

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764335.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057764335.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057764336.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764335.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764335.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5192247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B72
`Chr5:5192262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:5192436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B88
`Chr5:5192436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr5:5192952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,B89,B99,C87
`Chr5:5193537`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B41,B51,C27,C3,C50,C59
`Chr5:5193574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B19,B83,C54,C75
`Chr5:5193705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:5193887`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	58	A18,A21,A22,A7,B100,B106,B109,B11,B111,B117,B122,B123,B126,B127,B130,B135,B138,B17,B18,B19,B22,B24,B26,B27,B31,B34,B4,B50,B64,B66,B73,B75,B82,B86,B93,B97,C10,C15,C19,C20,C21,C24,C29,C30,C31,C32,C35,C36,C39,C4,C41,C42,C49,C51,C6,C68,C70,D3
`Chr5:5194029`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B21
`Chr5:5194029`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764335.1

206 aa

103

206

Tyr_Deacylase

PF02580 Tyr_Deacylase 59-202 aa

XP_057764336.1

200 aa

100

200

Tyr_Deacylase

PF02580 Tyr_Deacylase 59-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764335.1`	Pfam	`PF02580`	Tyr_Deacylase	Domain	59	202	7.3e-51	173.0	D-Tyr-tRNA(Tyr) deacylase
`XP_057764336.1`	Pfam	`PF02580`	Tyr_Deacylase	Domain	59	179	3.2e-38	132.0	D-Tyr-tRNA(Tyr) deacylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908352.1
ATTTTGAACACGGTTTGAGCTCGTGGGCCACACAAAATGGGCCTGAACAGATCGGCCCGTTTAAACGTTGCTTTTAACTCATGAAATTAGAAGTCCAGGTTGAAGAAAATTAGGAGTAATATTAGCAACTATGCTACCAAATTATGCTGGGTTTATGCAATCCCAACATCAAATTCAAACCTCATTTCATCTAGGAACCAAACACCACCTAATTGCCCTACGCCGATCCGCTATCCTACGCTCTAAGCGCACGAGTCGTG...

XM_057908353.1
ATTTTGAACACGGTTTGAGCTCGTGGGCCACACAAAATGGGCCTGAACAGATCGGCCCGTTTAAACGTTGCTTTTAACTCATGAAATTAGAAGTCCAGGTTGAAGAAAATTAGGAGTAATATTAGCAACTATGCTACCAAATTATGCTGGGTTTATGCAATCCCAACATCAAATTCAAACCTCATTTCATCTAGGAACCAAACACCACCTAATTGCCCTACGCCGATCCGCTATCCTACGCTCTAAGCGCACGAGTCGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985393
ATGCTACCAAATTATGCTGGGTTTATGCAATCCCAACATCAAATTCAAACCTCATTTCATCTAGGAACCAAACACCACCTAATTGCCCTACGCCGATCCGCTATCCTACGCTCTAAGCGCACGAGTCGTGTTTGCTCTGGAAGAAGGAAGCAAACAATCAAATCAATGAGGGCCGTGGTTCAGCGCGTAGCTTCTGCTAGCGTTGAGGTGGAAGGCCGCTTGATATCGTCGATTGGACCTGGCCTGCTTGTCCTCGTCGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764335.1
MLPNYAGFMQSQHQIQTSFHLGTKHHLIALRRSAILRSKRTSRVCSGRRKQTIKSMRAVVQRVASASVEVEGRLISSIGPGLLVLVGLHETDVDSDAEYICRKVLNMRLFQNENTGKTWDQNVMQKNYEVLLVSQFTLYGVLKGNKPDFHVAMPPAAAKSFYASLVERFQKAYRADAVKDGLFGAMMTVNLVNDGPVTMQLESRES

XP_057764336.1
MLPNYAGFMQSQHQIQTSFHLGTKHHLIALRRSAILRSKRTSRVCSGRRKQTIKSMRAVVQRVASASVEVEGRLISSIGPGLLVLVGLHETDVDSDAEYICRKVLNMRLFQNENTGKTWDQNVMQKNYEVLLVSQFTLYGVLKGNKPDFHVAMPPAAAKSFYASLVERFQKAYRADAVKALECSTRLCVASTKIVQQGLY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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