当前解析结果
SmilChr05G000686| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000686 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000686 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G000686 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 5200215 - 5202676 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130985398 |
|---|---|
| GeneID | 130985398 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985398 |
| 原始查询 | LOC130985398 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ATP synthase F1 complex assembly factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817966]; symbol=AT2G34050; hit=AT2G34050; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | ATP synthase F1 complex assembly factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817966]; symbol=AT2G34050; hit=AT2G34050; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G34050 (AT2G34050)ATP synthase F1 complex assembly factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817966] identity=74; qcov=0.775; evalue=4.21e-114; confidence=high |
| Rice | Os02g0312700 (P0705A04.3-1)- identity=70.8; qcov=0.771; evalue=6.55e-102; confidence=high |
| GO | GO:0005739 (mitochondrion); GO:0033615 (mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF06644 (ATP11) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985398 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057764339.1 |
| 2 | Mitochondrion matrix | 线粒体基质 | 1.00000 | XP_057764339.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057764339.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764339.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764339.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:5201017 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B101,B16,B75,C74 |
Chr5:5201092 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
Chr5:5201767 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
Chr5:5202217 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,B52 |
Chr5:5202252 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
Chr5:5202337 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,C12 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057764339.1PF06644
ATP11 78-244 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057764339.1 |
Pfam | PF06644 |
ATP11 | Family | 78 | 244 | 1.1e-36 | 127.8 | ATP11 protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。