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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000718`

染色体: Chr05 坐标: 5495658-5500209 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000718`
名称	SmilChr05G000718
描述	protein CHUP1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5495658 - 5500209 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985428`
GeneID	`130985428`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985428`
原始查询	`LOC130985428`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CHUP1, chloroplastic-like
产物	protein CHUP1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G18570` (AT4G18570) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827588] identity=75.9; qcov=0.445; evalue=1.16e-143; confidence=low
Rice	`Os05g0573900` - identity=72.4; qcov=0.376; evalue=1.38e-127; confidence=low
GO	GO:0009658 (chloroplast organization); GO:0009707 (chloroplast outer membrane)
KEGG	-
Pfam	PF26700 (IPGAL1_C); PF30907 (IPGA1_CC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985428

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764393.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057764393.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057764393.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764393.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764393.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5496165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C72,D5
`Chr5:5496354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:5496893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B36,C60,D8
`Chr5:5497008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B66,C32,C68,D10
`Chr5:5497693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr5:5497904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr5:5499674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr5:5499880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B45,C39
`Chr5:5499948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C82,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764393.1

654 aa

327

654

IPGA1_CC

IPGAL1_C

PF30907 IPGA1_CC 73-163 aa PF26700 IPGAL1_C 485-634 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764393.1`	Pfam	`PF30907`	IPGA1_CC	Coiled-coil	73	163	1.8e-32	112.3	IPGA1 coiled-coil
`XP_057764393.1`	Pfam	`PF26700`	IPGAL1_C	Domain	485	634	1.7e-62	210.5	IPGAL1-like, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908410.1
AAAAGATCCGTTTCTTGACATGGGATCACCCCTTACAAATTAAAGTCTCAAAAAGCTCCTTCCCCAAACGGCCGAGCTGTAGCATTTTAGTAATTTTAATTTTAATTTTAATATGAGAAAAGGATGAGAATTCTTCTCTCACTGTCGTTTATTTTTATCAACACTCTGGTACAGTTAGAACAGAAAGTGACTCAATCGTCCTTCTCCAACACGATAGCGTTGCCCGAGTTATCTTGAATTTAAGGAAACAAAATCAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985428
ATGGTTGCTGGCAAAGTAAAATCTGTAATGGGCTTGCAGAAATCCGTGGCGCCAACTAAGCAGAAGCCCGACGCCTCCGCCAAACCACCATGGTCAACCACGCCGAGTTCAGCCAAGCCACAGCCGCCGCCGCAGAAGGGATCCGCCGCTCCCTTCTCACGTTACTTCCCACGCGCATCGGCTCAGGTTCAGCCCCGCCCTCCCGACGTCTCCGAACTCCTCCGCCTCGTCGAGGAATTGCGAGAGAGCGAGTCTCGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764393.1
MVAGKVKSVMGLQKSVAPTKQKPDASAKPPWSTTPSSAKPQPPPQKGSAAPFSRYFPRASAQVQPRPPDVSELLRLVEELRESESRLKTELLEQKLVRESVAIVPVLESVISNKDSEIERSRRKIGCLEAENERLRSENEFLHMELSKQNQIYEEKIRHMQEELADIKIAVSERESDYEESSSSSTTVKLNDAATNNRKSNIPTKCLRKCTAQFSSKYETDARKDEISVATESNERARHPTTGNSDENPETSDVFTGIRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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