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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002644`

染色体: Chr01 坐标: 44703531-44704176 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002644`
名称	SmilChr01G002644
描述	nuclear transcription factor Y subunit C-3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44703531 - 44704176 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985440`
GeneID	`130985440`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985440`
原始查询	`LOC130985440`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transcription factor Y subunit C-3-like
产物	nuclear transcription factor Y subunit C-3-like
Arabidopsis	`AT1G54830` (NF-YC3) nuclear factor Y, subunit C3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841922] identity=68.3; qcov=0.738; evalue=4.53e-33; confidence=medium
Rice	`Os04g0683400` (OsHAP5G) - identity=63.2; qcov=1.06; evalue=4.43e-47; confidence=medium
GO	GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00125 (Histone); PF00808 (CBFD_NFYB_HMF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985440

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764408.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057764408.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764408.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764408.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764408.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44703894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr1:44703949`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B69,C64,C66
`Chr1:44703949`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B69,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764408.1

107 aa

107

Histone

CBFD_NFYB_HMF

PF00125 Histone 22-87 aa PF00808 CBFD_NFYB_HMF 23-87 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764408.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	22	87	7.2e-15	55.9	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain
`XP_057764408.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	23	87	5.7e-20	72.1	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908425.1
TAAATTATTAGCCCACCTAGCTAATATCTTCAGCCGGCCCCAAGTAGGCTGGCCGGCCACCCCCCTCGCACACACACTTTCTCACATATACCCGTATATATATTTCCAATAATTTCTTGCACACCACCAATCCAATAACTCATAGATACATATTCATCCGAAATTAAAACTGTTGAACCCTAGTTTGAGACGTTATTAACAAAACGGTGTAGCTGAGAGGAAGAAAATGAGGCAACCGGGGGCGTACTCGAATCTTGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985440
ATGAGGCAACCGGGGGCGTACTCGAATCTTGTGTGTGGCGGGATATCGGGGAAGACGGGACCCCATTCGTTGCCGCTAGCAAGAATCAAGAAGATAATGAAGAAATCGGGGGAGGACGTGAAGATGATATCGGGGGAGGCCCCCATCGTCTTCTCCAAGGCGTGTGAGCTGTTCATCGAGGAGTTGACGAAGAGGGCGTGGGAGATGACGCTGCAAGGGAAGAGAAGAACAATGCACAAGGAAGATGTGGCTGCTGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764408.1
MRQPGAYSNLVCGGISGKTGPHSLPLARIKKIMKKSGEDVKMISGEAPIVFSKACELFIEELTKRAWEMTLQGKRRTMHKEDVAAAVMETDIFDFLVTLVSHSPPAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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