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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000730`

染色体: Chr05 坐标: 5572591-5574633 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000730`
名称	SmilChr05G000730
描述	WUSCHEL-related homeobox 9-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5572591 - 5574633 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985442`
GeneID	`130985442`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985442`
原始查询	`LOC130985442`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WUSCHEL-related homeobox 9-like
产物	WUSCHEL-related homeobox 9-like
Arabidopsis	`AT5G45980` (WOX8) WUSCHEL related homeobox 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834638] identity=42.7; qcov=1.1; evalue=2.44e-70; confidence=medium
Rice	`Os05g0564500` (OsWOX9C) - identity=63.6; qcov=0.405; evalue=3e-47; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0050793 (regulation of developmental process)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985442

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764407.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764407.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764407.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764407.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764407.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5573067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr5:5573084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	198	A1,A10,A11,A13,A16,A18,A2,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B18,B19,B20,B21,B24,B25,B26,B29,B3,B31,B32,B33,B35,B37,B39,B40,B41,B42,B43,B46,B47,B48,B49,B5,B53,B55,B56,B59,B60,B61,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C13,C14,C15,C16,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C68,C69,C7,C70,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C86,C87,D11,D3,D4,D5,D7,D9
`Chr5:5573101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr5:5573101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:5573130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr5:5573166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C23,C73,C85
`Chr5:5573183`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B108,B75,C65
`Chr5:5573183`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B108,B75,C65
`Chr5:5574154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764407.1

326 aa

163

326

Homeodomain

PF00046 Homeodomain 52-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764407.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	52	111	9e-12	45.4	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908424.1
AAATATTCGTTCAAATACCAATATCTTATTTTTAAATTTACTACTAGAAAGGAGTGTCCATTAACATTTAATGCTGAGGTTGTGATCGCAGGAGTAGGTGATGCGAAGAGGAGGAGGCTATAAGAGGATTAGCAGTTTCATCACAGTCACACTGAAACTCTAGCACCAACCACCAAACCCTCTCAATTTTTGCTTGCCTTCTCTCTAAAACCTTCTCTCACTTTCCCCAATCATGGCTTCATCAAACAGACACTGGCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985442
ATGGCTTCATCAAACAGACACTGGCCTAGCATGTTCAAATCCAAGCCCTGCAACACCACTCACCTCCAGTGGCCGCATGACATCAACTCAATTTCATCAACCAAATCCCCATATGCACAAGGGCACGGATGCGACGAGAGAACACCGGAGCCGAAACCGCGCTGGAATCCTCGGCCGGAGCAAATCCGGATTCTGGAAGCCATCTTCAACTCGGGGATGGTGAATCCTCCCAGAGATGAGATTCGGAGAATTAGGGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764407.1
MASSNRHWPSMFKSKPCNTTHLQWPHDINSISSTKSPYAQGHGCDERTPEPKPRWNPRPEQIRILEAIFNSGMVNPPRDEIRRIRAQLQEYGQVGDANVFYWFQNRKSRSKHKQRQLQTSKAQPQSAAAPPPAPSPSSSSSDKSSSEKSISVGPASVIDLLSSPTASVNQPFFHGSTDFLSEPLYFPVQQSAAQEFGFPVADQNPNFLLSELMLMSNCPSKKNEEQFQSAPTNPPAVPPSFCVPSPSSDHLLQGVEECVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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