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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000736`

染色体: Chr05 坐标: 5616969-5621103 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000736`
名称	SmilChr05G000736
描述	uncharacterized SmilChr05G000736
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5616969 - 5621103 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985447`
GeneID	`130985447`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985447`
原始查询	`LOC130985447`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	deneddylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839753]; symbol=AT1G28530; hit=AT1G28530; species=arabidopsis; confidence=high
产物	deneddylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839753]; symbol=AT1G28530; hit=AT1G28530; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G28530` (AT1G28530) deneddylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839753] identity=49.2; qcov=0.881; evalue=2.41e-171; confidence=high
Rice	`Os02g0109900` - identity=35.8; qcov=0.919; evalue=3.46e-101; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26668 (DUF8223)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985447

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764414.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057764414.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057764414.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057764414.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764414.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5617243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:5617469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B14,B42,C26,C49
`Chr5:5618005`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B111
`Chr5:5618005`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B111
`Chr5:5618011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:5618017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:5618657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B19,C26,C54
`Chr5:5618671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B14,C26,C49
`Chr5:5618696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,C23,C71,C8,D4
`Chr5:5618980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B14,C26,C49
`Chr5:5619440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr5:5619471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764414.1

632 aa

316

632

DUF8223

PF26668 DUF8223 73-396 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764414.1`	Pfam	`PF26668`	DUF8223	Domain	73	396	6.2e-153	509.5	Domain of unknown function (DUF8223)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908431.1
GAGGCAAACTAACTAATATACTAATATAGTATGTGAAAAAACACACAGTACAGATATTGCGAAACTAAGAAAGATAACAGATTGATAAATCGCTAGTCTAGGCACGCGATATTCTCGATTATCCCCTGCAACTTTCATGTTCAACCTCAACGTTGAACCTCGTAGCATAAACCCTAACTACCATTTCTCAAGTTTCCATGGCGTTTGCTCCCGCACTCTCTCTCCTCATCCCTTTTTCACCTACCTCATCTTTTCCCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985447
ATGGCGTTTGCTCCCGCACTCTCTCTCCTCATCCCTTTTTCACCTACCTCATCTTTTCCCTTTAAGCCATCTCCCAAACTACTCTTTTGTCCTCCTAAATTTCTCAACTCTGTCCTCTCCGCCGCTTCTTCCTCCAACAGCCAACCGTTGCCGCCGTTCACTTCCGAGGAGGCCTTTCTCGATGCAATTGCCGGTTTCGGCGATACTGAGAAATTTCTTCCTGTCGTCAGGACTTATGAAAACGACTTGGCGCGGCTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764414.1
MAFAPALSLLIPFSPTSSFPFKPSPKLLFCPPKFLNSVLSAASSSNSQPLPPFTSEEAFLDAIAGFGDTEKFLPVVRTYENDLARLTLVGAVDSRQAITAAAADGGSTADEHISSGVTAMVVETIYPGPADDRSTVSTRLFLPTLKVKEKAIQLRKSMAKDMFQGISSKNILSMTFRQAVLEQLWSLELALFKPGTERNMSDLESPREVPVLLALSSSDELVISEIGEVVCAAALENTEKHFLSSSANRASKRLSSWLKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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