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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000739`

染色体: Chr05 坐标: 5633526-5637059 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000739`
名称	SmilChr05G000739
描述	OPA3-like protein
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5633526 - 5637059 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985451`
GeneID	`130985451`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985451`
原始查询	`LOC130985451`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OPA3-like protein
产物	OPA3-like protein
Arabidopsis	`AT1G28510` (AT1G28510) Optic atrophy 3 protein (OPA3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839751] identity=63.9; qcov=0.988; evalue=4.06e-75; confidence=high
Rice	`Os01g0242300` - identity=68.3; qcov=0.958; evalue=4.3e-80; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0019216 (regulation of lipid metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF07047 (OPA3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985451

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057764420.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057764420.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.80000	`XP_057764420.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764420.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764420.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5633899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D4
`Chr5:5633962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr5:5635463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:5635472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:5636624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764420.1

168 aa

168

OPA3

PF07047 OPA3 5-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764420.1`	Pfam	`PF07047`	OPA3	Family	5	125	2.3e-43	147.6	Optic atrophy 3 protein (OPA3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908437.1
AGTCCCCCAAGCAGGACTTGTAGGGCGCAAGGAAACTTCAGTGAGTGCGGGTGATTCAGATCATCGCCATCGCCATCGCCATCGCCATTATTCACAGCTCACACCCAATTTTTTATCTGTGCTCTTCAATCGTCATCATTCAGACTTCAATAACTTTTCGTTTTGCATTTTTGTCTTGCTTTACAAGAAACTTTGAACCAGTCAACCCTTTCCCCTCTGTTTATCCATCCTCAAGCATTAGTTTTTGTTTATGTTATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985451
ATGCTACCTCTATTGAAGCTCGGAACGCTTGCCCTAAAAACTCTGAGCAAACCCATTGCCGCTAAACTCAAGAAGCAGGCCGGGATTCACCCGAAATTCAGAAATGTGATAGTTAGCGTGGCCCAGGCTAATCACAGGATCACAACAACCATGCAAAGGCGCATATATGGTCATGCAACAGATGTGGAAATTCGACCTTTGAATGAAGAGAAGGCTGTTCAAGCTGCAGTTGATCTCATGGGGGAACTTTTTGTCTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764420.1
MLPLLKLGTLALKTLSKPIAAKLKKQAGIHPKFRNVIVSVAQANHRITTTMQRRIYGHATDVEIRPLNEEKAVQAAVDLMGELFVFSVAVAALIFEVQRSARSEAKKEEVRRQEMEGMRQRDEELAQEVELLKQKLAEIEQMAKVRGLAGVFNFRQAQAEEAKPSPVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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