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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000748`

染色体: Chr05 坐标: 5797285-5801799 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000748`
名称	SmilChr05G000748
描述	ribosome biogenesis protein NOP53
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5797285 - 5801799 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985462`
GeneID	`130985462`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985462`
原始查询	`LOC130985462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosome biogenesis protein NOP53
产物	ribosome biogenesis protein NOP53
Arabidopsis	`AT2G40430` (AT2G40430) Nop53 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818636] identity=53.1; qcov=0.648; evalue=4.46e-73; confidence=high
Rice	`Os05g0144200` - identity=57.5; qcov=1.04; evalue=7.59e-142; confidence=high
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0008097 (5S rRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF07767 (Nop53)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985462

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764430.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057764430.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.20000	`XP_057764430.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764430.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764430.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5799264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B7,C11,C69
`Chr5:5799418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:5799458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:5799474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr5:5800283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764430.1

372 aa

186

372

Nop53

PF07767 Nop53 8-357 aa

XP_057764433.1

372 aa

186

372

Nop53

PF07767 Nop53 8-357 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764430.1`	Pfam	`PF07767`	Nop53	Family	8	357	3.2e-65	221.7	Nop53 (60S ribosomal biogenesis)
`XP_057764433.1`	Pfam	`PF07767`	Nop53	Family	8	357	3.2e-65	221.7	Nop53 (60S ribosomal biogenesis)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908447.1
ATGGGTTAGAAACCCTTTTCAAAAGCGGCATTTCTATCTTCGCAGCGTCTTCTTCTATATGCGTTTTGCGTCCGCCTCTTTCGGTCGCCGTCGCCAGCCTCGCTTCGCCTAGGAATCTCTGCAGAAGCAGCCTGTGCCCCACCTCGTCTCAGTGCGCCGCTTCACGCTCCAGCATTTCCCGTCGTCAGGCCTCCTTCGACCTCGGCGCAGAACCAGCATCAACGCCGCCCCCCAGCCAAACAGCCGGGCCAACAGCAGGC...

XM_057908450.1
CGGCATTTCTATCTTCGCAGCGTCTTCTTCTATATGCGTTTTGCGTCCGCCTCTTTCGGTCGCCGTCGCCAGCCTCGCTTCGCCTAGGAATCTCTGCAGAAGCAGCCTGTGCCCCACCTCGTCTCAGTGCGCCGCTTCACGCTCCAGCATTTCCCGTCGTCAGGCCTCCTTCGACCTCGGCGCAGAACCAGCATCAACGCCGCCCCCCAGCCAAACAGCCGGGCCAACAGCAGTGCCGCAGGCTTCTCTATTTCGTGAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985462
ATGGGTAAGAGAGCCAAGAGTTCAAGGAAGGGAAAGAAAGAATGGAGGGCTAACATAAGCACTGAAGATATAGAAGATTATTTTGAGAAATCCACAAAAGACGCTCTTTCCGGTGGTTCTTTGGCTGATGTGCCCAGTGATTCTCTTTTCTTCGTTGATAAATCCAGAGATCTTTCTATTAAGCGGAAGATTGAGAAAAACAGAGAGAAAGTATTGCGATGTGATAGTCTGTTGCAGAGAAACCCTTTTATTAAAGCTAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764430.1
MGKRAKSSRKGKKEWRANISTEDIEDYFEKSTKDALSGGSLADVPSDSLFFVDKSRDLSIKRKIEKNREKVLRCDSLLQRNPFIKAIPSSIQNKKKSKRKGKALPTAADENVAQGSLKDESAHDSGVLDLWEEKGEVKAKIKKKPKSCVIPAVEVEHPGCSFNPHPESHQDALARAVADEMQKIYQHELGPQPIPLVVPGEAIDEEYKYFLEADADDGTDEDDDEQSENQADDADVDAEKSSQKTKRVTRVEFNRRARRK...

XP_057764433.1
MGKRAKSSRKGKKEWRANISTEDIEDYFEKSTKDALSGGSLADVPSDSLFFVDKSRDLSIKRKIEKNREKVLRCDSLLQRNPFIKAIPSSIQNKKKSKRKGKALPTAADENVAQGSLKDESAHDSGVLDLWEEKGEVKAKIKKKPKSCVIPAVEVEHPGCSFNPHPESHQDALARAVADEMQKIYQHELGPQPIPLVVPGEAIDEEYKYFLEADADDGTDEDDDEQSENQADDADVDAEKSSQKTKRVTRVEFNRRARRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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