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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr05G000770

染色体: Chr05 坐标: 6004898-6005865 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr05G000770
名称SmilChr05G000770
描述dormancy-associated protein 1
染色体 / SeqIDChr05 / NC_080391.1
坐标与链方向6004898 - 6005865 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130985485
GeneID130985485
locus_tag-
NCBI NameLOC130985485
原始查询LOC130985485

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述dormancy-associated protein 1
产物dormancy-associated protein 1
ArabidopsisAT1G28330 (DYL1)
dormancy-associated protein-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839729]
identity=64.8; qcov=1.05; evalue=1.15e-46; confidence=medium
RiceOs11g0671000 (ARP1)
-
identity=58.4; qcov=1.08; evalue=6.15e-35; confidence=medium
GO-
KEGG-
PfamPF05564 (Auxin_repressed)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130985485

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 0.80000 XP_057764463.1
2 Cytosol 细胞质基质 0.40000 XP_057764463.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057764463.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057764463.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057764463.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764463.1
116 aa
N
1
58
116
Auxin_repressed
C
PF05564 Auxin_repressed 7-116 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057764463.1 Pfam PF05564 Auxin_repressed Family 7 116 2e-49 167.8 Dormancy/auxin associated protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057908480.1
ACATGATGTTCATGCTCACTCCAAAACAAATTACAAGTAATTAAAAGGTTAAAGTGAGAAAAAAATGGTGCTTCTTGATCAACTGTGGGATGATGTTGTGGCCGGGCCGCAGCCCGACCGCGGCCTCAAACACCTCAAAAAGGTGTACACAAGCCCCAAAGACGGAGGAGAGGGCAGTGGCGTGGTGTACCAGAGGTCTCTGTCGATGCCGTCGAGCCCATCGACGCCGGGAACGCCGACAAATATGTCGCCGACGGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130985485
ATGGTGCTTCTTGATCAACTGTGGGATGATGTTGTGGCCGGGCCGCAGCCCGACCGCGGCCTCAAACACCTCAAAAAGGTGTACACAAGCCCCAAAGACGGAGGAGAGGGCAGTGGCGTGGTGTACCAGAGGTCTCTGTCGATGCCGTCGAGCCCATCGACGCCGGGAACGCCGACAAATATGTCGCCGACGGCGGGGAAAAAGGACAATGTGTGGCGGAGCGTCTTCAACCCGGGAAGCAACCTCGCCACCAAGAACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057764463.1
MVLLDQLWDDVVAGPQPDRGLKHLKKVYTSPKDGGEGSGVVYQRSLSMPSSPSTPGTPTNMSPTAGKKDNVWRSVFNPGSNLATKNVGSDYFDKPQPNSPTVYDWLYSGDTRSKHR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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