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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000772`

染色体: Chr05 坐标: 6020079-6026571 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000772`
名称	SmilChr05G000772
描述	glyoxysomal processing protease, glyoxysomal
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6020079 - 6026571 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985487`
GeneID	`130985487`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985487`
原始查询	`LOC130985487`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glyoxysomal processing protease, glyoxysomal
产物	glyoxysomal processing protease%2C glyoxysomal
Arabidopsis	`AT1G28320` (DEG15) protease-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839726] identity=47; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0497700` (OsDegp8) - identity=40.9; qcov=1.01; evalue=6.79e-160; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0005777 (peroxisome); GO:0016485 (protein processing)
KEGG	-
Pfam	PF13365 (Trypsin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985487

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057764470.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057764470.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057764470.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764470.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764470.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6022886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B45,B60,C39
`Chr5:6023954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B129,B77,C3,C62
`Chr5:6024108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr5:6025764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B45,B60,C39
`Chr5:6026248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B20,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764470.1

734 aa

367

734

Trypsin_2

PF13365 Trypsin_2 193-292 aa PF13365 Trypsin_2 392-614 aa

XP_057764471.1

734 aa

367

734

Trypsin_2

PF13365 Trypsin_2 193-292 aa PF13365 Trypsin_2 392-614 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764470.1`	Pfam	`PF13365`	Trypsin_2	Domain	193	292	4.9e-26	92.9	Trypsin-like peptidase domain
`XP_057764470.1`	Pfam	`PF13365`	Trypsin_2	Domain	392	614	4.9e-26	92.9	Trypsin-like peptidase domain
`XP_057764471.1`	Pfam	`PF13365`	Trypsin_2	Domain	193	292	4.9e-26	92.9	Trypsin-like peptidase domain
`XP_057764471.1`	Pfam	`PF13365`	Trypsin_2	Domain	392	614	4.9e-26	92.9	Trypsin-like peptidase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908487.1
GGTTAGTTTTTTTTCACAGGTGATGTTACTGTACTTCACTTTGGAAATTCCCAGTTTCTTATCATATTATGGGGAAAAAAGGACAGAAGCGAAAGAAAAGATTCCAAGCAACAGAGAATTGCGGCGGCCCAGCAAACGTCGTCGTCTGCTCCTGATAAGAAGGCGGCGCGGTGGTGTTATGCAACTTCACGGATAGACCCTTGGTTCTGAGATTGTCGGCATGGGTCTCCCTGAAGTTGCTGAGTTTGCTCGCAACTTCG...

XM_057908488.1
CACAGGTGATGTTACTGTACTTCACTTTGGAAATTCCCAGTTTCTTATCATATTATGGGGAAAAAAGGACAGAAGCGAAAGAAAAGATTCCAAGCAACAGAGAATTGCGGCGGCCCAGCAAACGTCGTCGTCTGCTCCTGGTATGCCCCATAAGAAGGCGGCGCGGTGGTGTTATGCAACTTCACGGATAGACCCTTGGTTCTGAGATTGTCGGCATGGGTCTCCCTGAAGTTGCTGAGTTTGCTCGCAACTTCGCTGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985487
ATGGGTCTCCCTGAAGTTGCTGAGTTTGCTCGCAACTTCGCTGTGATGGTCAGAGTTCAAGGCCCCGACCCGAAGGGTCTGAAAATGCGAAATCATGCTTTCCACCATTACAATTCTGGCAAAACAATGCTATCAGCTTCAGGAACGATTTTTCCAGCATCCAGCAACTTGGAATTGTCAGAGAGCATCTTGGTCTTGACAGTTGCATCCGTGATTGAACCATTTGTATCACAGTTGTACCAGGAAAGCATTTCAGAGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764470.1
MGLPEVAEFARNFAVMVRVQGPDPKGLKMRNHAFHHYNSGKTMLSASGTIFPASSNLELSESILVLTVASVIEPFVSQLYQESISEKKPRLIPGVQIDILMEDKSMVDGNMESLPWLPAQLLKMLDIPHSSAAVRSLIEASCGSPEHSWEVGWSLASHGRGPQHIDSSHEQVEQSPFQNHLPIGSMGSSSPNVMGQSATRIALLAVPSKFSAANPLKVQRSIPKRGNLLLAMGSPFGILSPLHFFNNISVGSIGNSYPPS...

XP_057764471.1
MGLPEVAEFARNFAVMVRVQGPDPKGLKMRNHAFHHYNSGKTMLSASGTIFPASSNLELSESILVLTVASVIEPFVSQLYQESISEKKPRLIPGVQIDILMEDKSMVDGNMESLPWLPAQLLKMLDIPHSSAAVRSLIEASCGSPEHSWEVGWSLASHGRGPQHIDSSHEQVEQSPFQNHLPIGSMGSSSPNVMGQSATRIALLAVPSKFSAANPLKVQRSIPKRGNLLLAMGSPFGILSPLHFFNNISVGSIGNSYPPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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