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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000778`

染色体: Chr05 坐标: 6078851-6080001 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000778`
名称	SmilChr05G000778
描述	uncharacterized protein ECU03_1610-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6078851 - 6080001 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985494`
GeneID	`130985494`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985494`
原始查询	`LOC130985494`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Late embryosis abundant protein (LEA) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827849]; symbol=AT4G21020; hit=AT4G21020; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Late embryosis abundant protein (LEA) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827849]; symbol=AT4G21020; hit=AT4G21020; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G21020` (AT4G21020) Late embryosis abundant protein (LEA) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827849] identity=32.3; qcov=1.09; evalue=6.41e-20; confidence=low
Rice	`Os04g0610600` (OsLEA18) - identity=40; qcov=0.551; evalue=3.98e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28479 (At4g13230)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985494

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057764478.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.40000	`XP_057764478.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764478.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764478.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764478.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6079140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:6079224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B100,B117,B119,C36
`Chr5:6079278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B33,C75
`Chr5:6079407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B112,B137,B57,C53
`Chr5:6079539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,A24,D3
`Chr5:6079586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B140,B76,C53
`Chr5:6079672`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A21,B100,B117,B119,C36
`Chr5:6079672`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A21,B100,B117,B119,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764478.1

245 aa

122

245

At4g13230

PF28479 At4g13230 149-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764478.1`	Pfam	`PF28479`	At4g13230	Family	149	215	3e-18	66.5	Uncharacterized protein At4g13230

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908495.1
GAAAGAAACAAGTCCCCGTAGCATAATTAGTATACACGTGGCACCTCCATCTACAGGTGTCCAACCATTCGCCCGCCACCTTCCTCCGCGATTGCACCTTATAACAATCCTTTTTCCGCCATACCCAAACCATAACATACTTCTGGAACTACAAATCAAGTTTTCAAGGAGAAACTAATCAAAAGCTATCATCGCAAACAAAGAGATGGCAGCCATGTCTGCAATGAAGAATGCAATTCTCAGCCTCTCCAAGTCTTCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985494
ATGGCAGCCATGTCTGCAATGAAGAATGCAATTCTCAGCCTCTCCAAGTCTTCGGAGATGGCCCAATCCATCCCCTTCCGCCCCACGGTGTCTCGAGTTTGCTTCGCCGCCGCTTCCAATCACCAACAGGGACGGAACATGGCCGGCGAGGCCGGCCGGAGAGAATACAGCCCGTACAACGCCGACGAGAGCGTGGACGAGCCCCGCGATGAGGTGAGAGAAACCATGGATAAGGCCAAGGAGAAGACTCGCGATATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764478.1
MAAMSAMKNAILSLSKSSEMAQSIPFRPTVSRVCFAAASNHQQGRNMAGEAGRREYSPYNADESVDEPRDEVRETMDKAKEKTRDMKDRAKESADDAADSVKEKAQQMNDKTKEKLGPMADKASDMRDKTVDATKRQAHEATEKVKGAAETAADKTKEYAHGAKETTKGAAEKVADAAKGAWGAAKDTTQKIKETVVGKSDDDDLDDFIEDRVKKPARDTREKVMDEDVVDARRRRADEHDRDKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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