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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000779`

染色体: Chr05 坐标: 6086141-6089998 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000779`
名称	SmilChr05G000779
描述	transcriptional corepressor LEUNIG_HOMOLOG-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6086141 - 6089998 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985495`
GeneID	`130985495`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985495`
原始查询	`LOC130985495`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcriptional corepressor LEUNIG_HOMOLOG-like
产物	transcriptional corepressor LEUNIG_HOMOLOG-like
Arabidopsis	`AT2G32700` (LUH) LEUNIG-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817830] identity=44.4; qcov=0.742; evalue=5.24e-95; confidence=medium
Rice	`Os02g0813800` (OsWD40-58) - identity=43.8; qcov=0.794; evalue=3.89e-100; confidence=medium
GO	GO:0003714 (transcription corepressor activity); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985495

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764479.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057764479.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764479.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764479.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764479.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6086404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B114,B129,B77,C3
`Chr5:6086413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,C18,D10,D8
`Chr5:6086454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C75
`Chr5:6086489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B69,C38,C44
`Chr5:6086995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,D11,D8
`Chr5:6088290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:6088770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B69,C38,C44
`Chr5:6088822`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A7,B115,B30,B38,C33,C85
`Chr5:6088847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B122,B13,C71
`Chr5:6088866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr5:6089329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C36
`Chr5:6089382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764479.1

446 aa

223

446

WD40

PF00400 WD40 160-196 aa PF00400 WD40 202-237 aa PF00400 WD40 243-281 aa PF00400 WD40 328-360 aa PF00400 WD40 410-445 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764479.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	160	196	8.5e-39	131.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057764479.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	202	237	8.5e-39	131.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057764479.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	243	281	8.5e-39	131.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057764479.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	328	360	8.5e-39	131.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057764479.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	410	445	8.5e-39	131.1	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908496.1
AGCTGGACAGAGAAATGTTGATGAACTTATTCTCATTTATGCTAAAGTTCACCTAAGTTCATGGGTGCTTGGGCAACATTCTCAGATGCATTGTTATGGCAATTGCAGTTATTCAATAGAGCAGCTTACTATATATTACCAACCTGCAATAGCTTACGTGAATATTAGAAGGAAGATATTAGAGAAAATATCATCGCAGGGGCATTCTTCACCTGTATTCAGTTTTGCTGATAACACTCCCGTGTCAGATCAACAGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985495
ATGCATTGTTATGGCAATTGCAGTTATTCAATAGAGCAGCTTACTATATATTACCAACCTGCAATAGCTTACGTGAATATTAGAAGGAAGATATTAGAGAAAATATCATCGCAGGGGCATTCTTCACCTGTATTCAGTTTTGCTGATAACACTCCCGTGTCAGATCAACAGAGAAAAAATTCATCTCCATCAGATATCTGTCAAGCAGATTGTTCATGTGAGTTGGCAGCACAAGCATCAAAAAAGCTTATAATAAGTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764479.1
MHCYGNCSYSIEQLTIYYQPAIAYVNIRRKILEKISSQGHSSPVFSFADNTPVSDQQRKNSSPSDICQADCSCELAAQASKKLIISPPDNSTKMTSPTLSNDGSKGKGVQIERNTELEGPFDEEIASFFSNYEAADNMTISFTHTSSQKLNDQQDFPFGPVRSLHPSNNKLSCCDFSTQGKFLAAAGHEKKIFIWNLKQSTRYSFQGHTQLITDIRFKPNSNMFATSSFDRIVKIWDAANTKKILYNLVGHADQVMSVDF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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