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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000785`

染色体: Chr05 坐标: 6126607-6127889 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000785`
名称	SmilChr05G000785
描述	VQ motif-containing protein 4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6126607 - 6127889 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985500`
GeneID	`130985500`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985500`
原始查询	`LOC130985500`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	VQ motif-containing protein 4
产物	VQ motif-containing protein 4
Arabidopsis	`AT1G28280` (AT1G28280) VQ motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839722] identity=54.5; qcov=1.08; evalue=1.86e-64; confidence=high
Rice	`Os01g0747800` (OsVQ3) - identity=47.8; qcov=0.899; evalue=2.84e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05678 (VQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985500

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764484.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057764484.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057764484.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764484.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764484.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6126941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:6126989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B12,C62,C80
`Chr5:6127046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr5:6127053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr5:6127157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B132,B35,C47,C61
`Chr5:6127196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,D11
`Chr5:6127270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr5:6127271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr5:6127284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B59,C24
`Chr5:6127286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B13,B38,B39,B40
`Chr5:6127288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr5:6127291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764484.1

228 aa

114

228

PF05678 VQ 50-76 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764484.1`	Pfam	`PF05678`	VQ	Motif	50	76	2.3e-11	43.7	VQ motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908501.1
CATAGGTGTATAATTTTTAGAAAAAAAAATTAATACAGTGATACTCATTTTTCATTTACGATGACATGACTCAAAGCTTCTAATTTATTGATCGGAAAGGAAGCATACTTAAAGGTGTGTGATTGTGAAAACAAAACATAAAGTTGACGCTCTCTAACTGCGGATAGGGTTTGTTTTGAGAAGCGACAACTAAACGTTTCTTACCAACCAGAGAAAGTTACAAACAAGTGATGCAAAAATAATCCTAAAACTCAATTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985500
ATGGAGAGGTCATCCGTAATCCAAGAATCCCAAAACCCCTCACTAATCCCTTCCCCAAACAGCTCGAGCAGCAGCACTTCCACCACCACCAATGGCCTCCGCCACTCCCCTTCCTCCATTCCCATCACAAGATCCGACCCCAACAACCCCTACCCGACCACCTTCGTCCAGGCCGACACCTCCTCCTTCAAGCAGGTCGTCCAAATGCTCACCGGCTCCACCGACGCCGCCGCCCCCGCCCGCCCCGAACCCTTCAGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764484.1
MERSSVIQESQNPSLIPSPNSSSSSTSTTTNGLRHSPSSIPITRSDPNNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSTDAAAPARPEPFRSPIPPIKRKDKSSSKLYERRNSLKNFKISPLAPGLVNTRPAFLAGSPRPGTPEVLSPSILDFPSLVLSPVTPLIPDPFNRATNSKSNLNTLAEDKAIKEKGFYFHPSPANTPRDSEPRLLPLFPVTSPRLAGSSAAAAAADS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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