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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000817`

染色体: Chr05 坐标: 6399822-6407937 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000817`
名称	SmilChr05G000817
描述	uncharacterized SmilChr05G000817
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6399822 - 6407937 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985533`
GeneID	`130985533`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985533`
原始查询	`LOC130985533`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bromodomain 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745841]; symbol=BRD4; hit=AT1G61215; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	bromodomain 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745841]; symbol=BRD4; hit=AT1G61215; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G61215` (BRD4) bromodomain 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745841] identity=42.2; qcov=0.82; evalue=1.2e-71; confidence=medium
Rice	`Os07g0565300` (OJ1773_H01.106) - identity=32; qcov=0.863; evalue=2.47e-52; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00439 (Bromodomain)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985533

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764532.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764532.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764532.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764532.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764532.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6400155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A13,A18,A19,A8,B107,B118,B123,B3,B33,B70,C13,C15,C4,C55,C82,C87
`Chr5:6400308`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B28
`Chr5:6405380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B112
`Chr5:6405410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:6405926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C36
`Chr5:6406095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:6406277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:6406663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:6406771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C23
`Chr5:6407268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B111,B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764532.1

460 aa

230

460

Bromodomain

PF00439 Bromodomain 264-344 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764532.1`	Pfam	`PF00439`	Bromodomain	Domain	264	344	1.2e-09	38.7	Bromodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908549.1
ATAGACGTAATAAAAGTTTATACTTCTTTATCATCTGGTAGTAGTCTCAACTTTTAACTCAATTTTTTTGGTATGCGTTGTGTGCTCTCGTGATAAAATAGTGAATGCTTGATCTTGTTAAAGGGAAATAATGATGAGTGATGAAATTTAGCCTATCAAGTGGTCGCCTGATCGGATAAGAATTTAAATTCACAAAACAACATATAAACACAATGCTATCTTTATTAGATTAGGAGAAGGTTTGTGTGTGTTTTTATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985533
ATGGGGGCAGAGGATGGTTGGAACTCGTGGGCGGAGCTTATCCTGGCAGCCGCCGTTCTGAGGCACGGCCAACACCGCTGGGACGTTGTTGCTTCGGAGCTCCGAACCCGTTCCCGCGACCCCACGCTATTCACCCCCGAGTTGCAGGTTTGCAAAAGCAAGTACAATGAGCTGCAAAAGCGTTATTCTGGGTCCAGGGTCTGGTTTGAAGAGCTGAGAAAGCAATGTGTGGCGGAGCTGAAGCAACAACTGGCAAGATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764532.1
MGAEDGWNSWAELILAAAVLRHGQHRWDVVASELRTRSRDPTLFTPELQVCKSKYNELQKRYSGSRVWFEELRKQCVAELKQQLARSEASIGFLESKIKYLESEKQNPYQADCDWSQTGSPNFDGTDPSSQNTSKDEHSAGSYTEDPRTRTDLPCKRHHQEMEIGTSPSLSVSYEGDKDLGIQKLAEAGQELIAGKRRGRKRKKDCKQAVTEVSVGERDNLGSSNAGSTSQKEATATPYNQNRHSAVKSHSVNDAYTIKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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