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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000837`

染色体: Chr05 坐标: 6605973-6606811 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000837`
名称	SmilChr05G000837
描述	transcription factor MYB14-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6605973 - 6606811 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985548`
GeneID	`130985548`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985548`
原始查询	`LOC130985548`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB14-like
产物	transcription factor MYB14-like
Arabidopsis	`AT3G23250` (MYB15) myb domain protein 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821904] identity=62.2; qcov=0.791; evalue=3.27e-68; confidence=high
Rice	`Os02g0624300` (OsMYB30) - identity=72.6; qcov=0.53; evalue=4.7e-65; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985548

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764556.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764556.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764556.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764556.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764556.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6605974`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B137,B83,C10
`Chr5:6605974`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B137,B83,C10
`Chr5:6606009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B13,B16,C30,D4
`Chr5:6606027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:6606085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr5:6606139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A18,A19,B19,B22,B26,B4,B41,B59,B74,C10,C14,C17,C19,C2,C21,C22,C30,C31,C33,C35,C39,C4,C52
`Chr5:6606159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B27,C73,D6
`Chr5:6606181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr5:6606191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C61
`Chr5:6606195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B111,C36
`Chr5:6606209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr5:6606237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C31,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764556.1

234 aa

117

234

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-76 aa PF00249 Myb_DNA-binding 67-112 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 70-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764556.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	4.2e-33	113.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057764556.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	76	3.7e-21	75.8	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057764556.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	67	112	4.2e-33	113.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057764556.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	70	118	3.7e-21	75.8	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908573.1
ATGGTTAGGGCTCCATGCTGCGATAAAACGGGCCTGAAGAAAGGCTTGTGGACTGCGGAAGAAGATCAAATTCTCATCAACTTCATCACCCAAAATGGGCATCCCAATTGGCGGGCACTTCCCAAACAGGCCGGATTGTTGAGGTGTGGAAAGAGTTGTCGTCTCCGGTGGATGAACTACTTGCGCCCCGATATTAGGAGAGGGAATTTTACCAAACAAGAGGAGGATTCTATCATTCAATTGCATGCACAATTGGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985548
ATGGTTAGGGCTCCATGCTGCGATAAAACGGGCCTGAAGAAAGGCTTGTGGACTGCGGAAGAAGATCAAATTCTCATCAACTTCATCACCCAAAATGGGCATCCCAATTGGCGGGCACTTCCCAAACAGGCCGGATTGTTGAGGTGTGGAAAGAGTTGTCGTCTCCGGTGGATGAACTACTTGCGCCCCGATATTAGGAGAGGGAATTTTACCAAACAAGAGGAGGATTCTATCATTCAATTGCATGCACAATTGGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764556.1
MVRAPCCDKTGLKKGLWTAEEDQILINFITQNGHPNWRALPKQAGLLRCGKSCRLRWMNYLRPDIRRGNFTKQEEDSIIQLHAQLGNKWSVIASRLSGRTDNEIKNVWHTYLKKRVARKYQPQPQIKTGEVEYSSNQYCQQVELSMPGESLSEVSSAIISDDALMSNLLYKWPEMGESFWLEVFPVEEWSDISDFSSGYNHPDQLRFADSELNMEDCSVWSDVFNKANELTELI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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