Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G002663

染色体: Chr01 坐标: 44870500-44872319 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G002663
名称SmilChr01G002663
描述probable protein ABIL1
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向44870500 - 44872319 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130985562
GeneID130985562
locus_tag-
NCBI NameLOC130985562
原始查询LOC130985562

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述probable protein ABIL1
产物probable protein ABIL1
ArabidopsisAT5G42030 (ABIL4)
ABL interactor-like protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834208]
identity=34.1; qcov=0.531; evalue=1.15e-21; confidence=low
RiceOs01g0760900
-
identity=43.2; qcov=0.465; evalue=6.07e-27; confidence=medium
GO-
KEGG-
PfamPF27594 (ABI)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130985562

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057764579.1
2 Nucleus membrane 核膜 0.20000 XP_057764579.1
3 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057764579.1
4 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057764579.1
5 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057764579.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764579.1
255 aa
N
1
128
255
ABI
C
PF27594 ABI 20-80 aa
XP_057764589.1
254 aa
N
1
127
254
ABI
C
PF27594 ABI 20-80 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057764579.1 Pfam PF27594 ABI Domain 20 80 2e-13 50.8 Abl interactor protein
XP_057764589.1 Pfam PF27594 ABI Domain 20 80 2e-13 50.9 Abl interactor protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA
XM_057908606.1
ACAAGGACTACTCACGAGACTCAAAGCACTGATCAAATTGTCCAAAAAAAACAAAAAAAATATTTCAGCATATTTAAATAAATATGAAGGTGCAACAGAGTCTATTTTCAGTTTCTGAATCAGCAAAGAAAAATGGATGAGAAAATGGTGGAGGAGGATTCCGAAGCCGTGGTTGATGACGTAGCACAGTTCCACAAATCTCTCAAAGAGCTAAGGAACTTCAGCTCTCAGCTCTACCAGGCTGCTGATTACTGCAAAAC...
XM_057908596.1
AAGGACTACTCACGAGACTCAAAGCACTGATCAAATTGTCCAAAAAAAACAAAAAAAATATTTCAGCATATTTAAATAAATATGAAGGTGCAACAGAGTCTATTTTCAGTTTCTGAATCAGCAAAGAAAAATGGATGAGAAAATGGTGGAGGAGGATTCCGAAGCCGTGGTTGATGACGTAGCACAGTTCCACAAATCTCTCAAAGAGCTAAGGAACTTCAGCTCTCAGCTCTACCAGGCTGCTGATTACTGCAAAACAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
LOC130985562
ATGGATGAGAAAATGGTGGAGGAGGATTCCGAAGCCGTGGTTGATGACGTAGCACAGTTCCACAAATCTCTCAAAGAGCTAAGGAACTTCAGCTCTCAGCTCTACCAGGCTGCTGATTACTGCAAAACAGCTTTCTTGAGCTCCCAAGACAAGACTCAAATTCTTGAGACGACGAAAGAGTACGTGTCCCGGGCCGTAGTGGTAGTGGTGGATCATCTAGGAACCATTTCAGCAAATCTTGAATGCTGCATTTCTAAGAC...
LOC130985562
ATGGATGAGAAAATGGTGGAGGAGGATTCCGAAGCCGTGGTTGATGACGTAGCACAGTTCCACAAATCTCTCAAAGAGCTAAGGAACTTCAGCTCTCAGCTCTACCAGGCTGCTGATTACTGCAAAACAGCTTTCTTGAGCTCCCAAGACAAGACTCAAATTCTTGAGACGACGAAAGAGTACGTGTCCCGGGCCGTAGTGGTAGTGGTGGATCATCTAGGAACCATTTCAGCAAATCTTGAATGCTGCATTTCTAAGAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057764579.1
MDEKMVEEDSEAVVDDVAQFHKSLKELRNFSSQLYQAADYCKTAFLSSQDKTQILETTKEYVSRAVVVVVDHLGTISANLECCISKTDSLSQTEGKIESLKQRIGTCQIYSYRISVPRFQWGADFPRYHRRYVSPPASKDSTVWSDVSRYSKRCIDAKNEEAMELLFNCNSSSVVESSSSTEMKKKNVVPVPLNSFTNYKILDDDDGLSVLPKTNNLVFQFQEVGKLKRGAINWKAMMQSKDIAALIRRGKRLLA
XP_057764589.1
MDEKMVEEDSEAVVDDVAQFHKSLKELRNFSSQLYQAADYCKTAFLSSQDKTQILETTKEYVSRAVVVVVDHLGTISANLECCISKTDSLSQTEGKIESLKQRIGTCQIYSYRISVPRFQWGADFPRYHRRYVSPPSKDSTVWSDVSRYSKRCIDAKNEEAMELLFNCNSSSVVESSSSTEMKKKNVVPVPLNSFTNYKILDDDDGLSVLPKTNNLVFQFQEVGKLKRGAINWKAMMQSKDIAALIRRGKRLLA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器