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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000852`

染色体: Chr05 坐标: 6721595-6724390 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000852`
名称	SmilChr05G000852
描述	clathrin light chain 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6721595 - 6724390 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985565`
GeneID	`130985565`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985565`
原始查询	`LOC130985565`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clathrin light chain 2-like
产物	clathrin light chain 2-like
Arabidopsis	`AT2G20760` (AT2G20760) Clathrin light chain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816605] identity=70; qcov=0.581; evalue=2.92e-70; confidence=medium
Rice	`Os06g0731800` - identity=74.7; qcov=0.484; evalue=3.56e-63; confidence=medium
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0030130 (clathrin coat of trans-Golgi network vesicle); GO:0030132 (clathrin coat of coated pit); GO:0032050 (clathrin heavy chain binding); GO:0048268 (clathrin coat assembly); GO:0072583 (clathrin-dependent endocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF01086 (Clathrin_lg_ch)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985565

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057764585.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057764585.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057764585.1`
4	Pseudopodium	Pseudopodium	0.20000	`XP_057764585.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764585.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6721816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D6
`Chr5:6721818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr5:6721852`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C28
`Chr5:6721852`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C28
`Chr5:6721868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B87,B88
`Chr5:6722119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3
`Chr5:6723592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:6723756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C73,D11,D6
`Chr5:6723758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr5:6723816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:6724070`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C86
`Chr5:6724070`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764585.1

310 aa

155

310

Clathrin_lg_ch

PF01086 Clathrin_lg_ch 104-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764585.1`	Pfam	`PF01086`	Clathrin_lg_ch	Family	104	209	2.2e-12	48.1	Clathrin light chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908602.1
TATAAGCTGGACTTCCACCGATGAATTAGTAGTAATTGTGAAGTAAAGTTGTTAAACAAATCGAACTAATTAAAGAAGGTTTAATTTTAAAAACAAAATCTGTGTTCTGTTTGGACGGTTATATAGACACATCAATTCCAGCACCAACTAATACTCATTCTTTATTCTAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAAATGGCGTCGGCGCGTTCATTTGACGACGGTGGGTACACTACCTTTGATGATTCCTACGCCGCATTTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985565
ATGGCGTCGGCGCGTTCATTTGACGACGGTGGGTACACTACCTTTGATGATTCCTACGCCGCATTTTCCTCAGCCGATGCGCCGCCTTACTCCGCTCCCGCCTACGCCCCGCAGTACGGCGACACTGAGGAAGCGACGGTGGATCACGCGAACGGCGACGATCCGTTTGGATTCGGGTCTAATGATCAACCAGTCGTATCGTCCGGCACGATTCCTATCGCTAATGGTAACGGAAGCTCGCCTTTTGACATTGGGGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764585.1
MASARSFDDGGYTTFDDSYAAFSSADAPPYSAPAYAPQYGDTEEATVDHANGDDPFGFGSNDQPVVSSGTIPIANGNGSSPFDIGEDSEGIFSSDGPILPPPSEMQEQGFALREWRRQNAIQLEEKEKREKEMRNQIIEEAEEYKQAFYEKRKLNVETNKTTNREREKLSLAGQEKFHKEADKQYWKAIAELVPNEVANIEKRGKKKDQDKKPSIAVIQGPKPGKPTDLSRMRGILVKLKHNPPPHMLPPLPAPAKDGKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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