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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000855`

染色体: Chr05 坐标: 6749746-6751092 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000855`
名称	SmilChr05G000855
描述	stem-specific protein TSJT1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6749746 - 6751092 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985567`
GeneID	`130985567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985567`
原始查询	`LOC130985567`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stem-specific protein TSJT1-like
产物	stem-specific protein TSJT1-like
Arabidopsis	`AT4G27450` (AT4G27450) aluminum induced protein with YGL and LRDR motifs [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828854] identity=59.4; qcov=0.996; evalue=4.97e-110; confidence=high
Rice	`Os04g0679400` - identity=55.2; qcov=1; evalue=1.82e-95; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12481 (DUF3700)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057764590.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057764590.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764590.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764590.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764590.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6750065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B113,B9,C26
`Chr5:6750086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr5:6750400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:6750743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B9,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764590.1

250 aa

125

250

DUF3700

PF12481 DUF3700 2-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764590.1`	Pfam	`PF12481`	DUF3700	Domain	2	228	9.7e-90	300.7	Aluminium induced protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908607.1
AAAAGATTTCCCATTTTGTCGTTTTGGATAACATGGCCACCAACTTTTCCGCTTCTACTAACGTCTATAAAAACTCAAATTCCTCATATCCATTCATGCATTTGCCATCGCCCTCTGCATTCATTCATTCATCTGCTTTTATTTATACCCATTTCACATTTTCCGCCTAGATTAAATTAGTAAAAATGTTGAGTATATTCAGGAACGGCGTGATTGATCCACCGCGAGAGCTACACAGCCCAGCCCCATCGACGGCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985567
ATGTTGAGTATATTCAGGAACGGCGTGATTGATCCACCGCGAGAGCTACACAGCCCAGCCCCATCGACGGCTTCCGTGAGATCCAAGACTCCAGATGATACTCTCAAGGATTTCTTAGATTCGAACCCCAAAAATGGCTTCTCCGTCCAGTTCGTAGACAAGGCCGTCCTGGCCCATGCCTCCCCTCAGCTTACCCCCCATCGAAGTTTGTTCTCGGGGGTGGATGATGTGTACTGCATTTTCATGGGGGATCTGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764590.1
MLSIFRNGVIDPPRELHSPAPSTASVRSKTPDDTLKDFLDSNPKNGFSVQFVDKAVLAHASPQLTPHRSLFSGVDDVYCIFMGDLKNLCLLNKQYGLTKCGNEALFVIEAYRTLRDRSPMPAHQVLKELEGSFAFVIYDHKYDTVFAALGADKALNLFWGVSADGSVMISDNVALIKASCRKSYAPFPPGCMYHSDRGLISFEHPMHKMKAMPRIDSEGAMCGSYFAVDAYSKVNSMPRVGSSANWSTWG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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