当前解析结果
SmilChr05G000857| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000857 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000857 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G000857 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 6771295 - 6774452 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985569 |
|---|---|
| GeneID | 130985569 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985569 |
| 原始查询 | LOC130985569 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0731700; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0731700; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G41950 (AT5G41950)Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834200] identity=33; qcov=0.184; evalue=1.09e-06; confidence=weak |
| Rice | Os06g0731700- identity=51.5; qcov=0.435; evalue=6.29e-92; confidence=low |
| GO | GO:0005515 (protein binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985569 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057764592.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.60000 | XP_057764592.1 |
| 3 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.40000 | XP_057764593.1 |
| 4 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057764593.1 |
| 5 | Peroxisome membrane | 过氧化物酶体膜 | 0.20000 | XP_057764593.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:6771679 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A10,B9 |
Chr5:6771704 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B73 |
Chr5:6771741 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
Chr5:6772709 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B56,B96,C61 |
Chr5:6772799 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B134,D7 |
Chr5:6772881 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
Chr5:6772884 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B24 |
Chr5:6772946 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B121,B27,B4,B54 |
Chr5:6773055 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:6773167 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B136,C13,C41 |
Chr5:6773276 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr5:6773393 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。