当前解析结果
SmilChr05G000856| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000856 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000856 |
| 描述 | CBS domain-containing protein CBSX5-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 6768829 - 6771109 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130985572 |
|---|---|
| GeneID | 130985572 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985572 |
| 原始查询 | LOC130985572 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | CBS domain-containing protein CBSX5-like |
| 产物 | CBS domain-containing protein CBSX5-like |
| Arabidopsis | AT4G27460 (CBSX5)Cystathionine beta-synthase (CBS) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828855] identity=40.9; qcov=0.997; evalue=3.23e-79; confidence=medium |
| Rice | Os10g0499400- identity=43; qcov=0.716; evalue=3.14e-54; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985572 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057764598.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057764598.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057764598.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:6768991 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B113,B9,C26 |
Chr5:6769088 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr5:6769133 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B36,B57,C34,C36 |
Chr5:6769140 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C75 |
Chr5:6769142 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B66,C32,C68 |
Chr5:6770088 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B66,C68 |
Chr5:6770134 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B66,C32,C68 |
Chr5:6770146 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B59,B89 |
Chr5:6770187 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C61 |
Chr5:6770189 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B121,B27,B4,B54,C5 |
Chr5:6770385 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C51 |
Chr5:6770554 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。