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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000869`

染色体: Chr05 坐标: 6880445-6881063 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000869`
名称	SmilChr05G000869
描述	probable calcium-binding protein CML15
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6880445 - 6881063 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985580`
GeneID	`130985580`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985580`
原始查询	`LOC130985580`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable calcium-binding protein CML15
产物	probable calcium-binding protein CML15
Arabidopsis	`AT3G25600` (AT3G25600) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822147] identity=75; qcov=0.48; evalue=4.22e-20; confidence=low
Rice	`Os01g0604500` (OsCML12) - identity=62.5; qcov=0.48; evalue=7.91e-17; confidence=low
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13202 (EF-hand_5); PF13499 (EF-hand_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985580

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057764609.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057764609.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057764609.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764609.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764609.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6880756`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A10,B54,C59,C72
`Chr5:6880756`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A10,B54,C59,C72
`Chr5:6880757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,C82
`Chr5:6880759`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A10,B54,C72
`Chr5:6880759`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A10,B54,C72
`Chr5:6880768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr5:6880771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B74
`Chr5:6880774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B49
`Chr5:6880816`	`CCA`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A18,A24,B30,B60
`Chr5:6880823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B81,C41,C6
`Chr5:6880831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B15,C36
`Chr5:6880862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B94,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764609.1

100 aa

100

EF-hand_7

EF-hand_5

PF13499 EF-hand_7 17-64 aa PF13202 EF-hand_5 18-31 aa PF13202 EF-hand_5 49-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764609.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	17	64	4.1e-07	31.0	EF-hand domain pair
`XP_057764609.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	18	31	2.9e-08	33.5	EF hand
`XP_057764609.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	49	64	2.9e-08	33.5	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908626.1
CCACAATGGTGCGCCGCTCCCTCCCCATTTTCGGTTTTTCCCTTCTCCTCGCCAACATGGACGCCAACGGCAACGGCTACATCACCGCCGCCGAAATCGCCGGTCAGATGGCCAAGATGGGCCACCCCCTCACCTATCGCGAGCTCAGCGACATGATGCAGGAGGCCGACACCAACGGCGACGGTGTCATCAGCTTGAAGGCAGCGGCGGTGGGTGGCGGCGTTGGGCAAATCCGCATCGGCGGTTGGTTGGCCGCGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985580
ATGGTGCGCCGCTCCCTCCCCATTTTCGGTTTTTCCCTTCTCCTCGCCAACATGGACGCCAACGGCAACGGCTACATCACCGCCGCCGAAATCGCCGGTCAGATGGCCAAGATGGGCCACCCCCTCACCTATCGCGAGCTCAGCGACATGATGCAGGAGGCCGACACCAACGGCGACGGTGTCATCAGCTTGAAGGCAGCGGCGGTGGGTGGCGGCGTTGGGCAAATCCGCATCGGCGGTTGGTTGGCCGCGAAGGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764609.1
MVRRSLPIFGFSLLLANMDANGNGYITAAEIAGQMAKMGHPLTYRELSDMMQEADTNGDGVISLKAAAVGGGVGQIRIGGWLAAKAAAVGGGESGFDPSR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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