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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002665`

染色体: Chr01 坐标: 44877499-44882288 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002665`
名称	SmilChr01G002665
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44877499 - 44882288 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985583`
GeneID	`130985583`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985583`
原始查询	`LOC130985583`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=35.7; qcov=0.477; evalue=3.43e-13; confidence=low
Rice	`Os02g0550900` - identity=43.5; qcov=0.685; evalue=5.61e-38; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985583

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764615.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764615.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764615.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764615.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764615.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44877971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B28
`Chr1:44881048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764615.1

284 aa

142

284

FAR1

PF03101 FAR1 98-185 aa

XP_057764625.1

251 aa

126

251

FAR1

PF03101 FAR1 65-152 aa

XP_057764630.1

251 aa

126

251

FAR1

PF03101 FAR1 65-152 aa

XP_057764634.1

235 aa

118

235

FAR1

PF03101 FAR1 98-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764615.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	98	185	6.3e-25	88.4	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057764625.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	65	152	4.9e-25	88.8	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057764630.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	65	152	4.9e-25	88.8	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057764634.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	98	185	3.1e-25	89.4	FAR1 DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089028.1
ATCGCCGGTGCGTCCACGTCTACAAATTCCGGGAGACACGTCTTTTAGAATTTAAGGGATGATCACTGCATGTGCAAATTGCAATTAAATCAAAATGTGATGTATTTTGAAGCTATTTTTTAAGGTTATGTGCAAAACACAAATTCGATAATAATTCGTGTATTTTTTAGCTATTAACCCAATAATAAATGAAAATAAACCTTCAATCACAAAGATCTAAGTTGAATGAACATTTTAATAGATAAATACAATAAGTCAAT...

XM_057908651.1
ATCGCCGGTGCGTCCACGTCTACAAATTCCGGGAGACACGTCTTTTAGAATTTAAGGGATGATCACTGCATGTGCAAATTGCAATTAAATCAAAATGTGATGTATTTTGAAGCTATTTTTTAAGGTTATGTGCAAAACACAAATTCGATAATAATTCGTGTATTTTTTAGCTATTAACCCAATAATAAATGAAAATAAACCTTCAATCACAAAGATCTAAGTTGAATGAACATTTTAATAGATAAATACAATAAGTCAAT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130985583
ATGCACCCAAAATTACTTTCAAATTCCGCCTCCGCCGTCCCTGCCGCCACCACGTCCGCCGTCGCCTTGGTAAACCACGCCCCTCCTTCAATTGCAGAGATGGAAAATTCTGGATTCGACCTGGAACTCCACGGAGCTGCCTGTGGAGATAGTGATGAAGAAGGAGTTGCACTGCCACGTTCTGTTGGAGAAGTCGTTGATGGGAATGAGGGGCAAGATGAAGGTCATATTTTGGAGTTGGAAAAGAAATTATTGGAGCA...

LOC130985583
ATGGAAAATTCTGGATTCGACCTGGAACTCCACGGAGCTGCCTGTGGAGATAGTGATGAAGAAGGAGTTGCACTGCCACGTTCTGTTGGAGAAGTCGTTGATGGGAATGAGGGGCAAGATGAAGGTCATATTTTGGAGTTGGAAAAGAAATTATTGGAGCAAGTCGTGTACAGTGAGGAAGAAGCATACATGCTGTACTGTGATTATGCGACTGCCATGGGTTTTAATGTACGTAGGGGAAAGCAATACTATTTTATGGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057764615.1
MHPKLLSNSASAVPAATTSAVALVNHAPPSIAEMENSGFDLELHGAACGDSDEEGVALPRSVGEVVDGNEGQDEGHILELEKKLLEQVVYSEEEAYMLYCDYATAMGFNVRRGKQYYFMGTKRVRSKTYCCSKEGVKDDKADTNGVGYKKPETRTGCRAMISFICDDSGQWKVSRFVKEHNHEMAPPYAKPLVKSGQAILAANVYGSGGALESLSEHDKIRELSLQLAIAKNRAETSEKLAATYKRQLHMIVGHIEDHNQ...

XP_057764625.1
MENSGFDLELHGAACGDSDEEGVALPRSVGEVVDGNEGQDEGHILELEKKLLEQVVYSEEEAYMLYCDYATAMGFNVRRGKQYYFMGTKRVRSKTYCCSKEGVKDDKADTNGVGYKKPETRTGCRAMISFICDDSGQWKVSRFVKEHNHEMAPPYAKPLVKSGQAILAANVYGSGGALESLSEHDKIRELSLQLAIAKNRAETSEKLAATYKRQLHMIVGHIEDHNQSLSNKIQKVLNNVEELESEDRKKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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