当前解析结果
SmilChr05G000885| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000885 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000885 |
| 描述 | F-box protein At1g61340-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 7005807 - 7007797 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130985599 |
|---|---|
| GeneID | 130985599 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985599 |
| 原始查询 | LOC130985599 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | F-box protein At1g61340-like |
| 产物 | F-box protein At1g61340-like |
| Arabidopsis | AT1G61340 (FBS1)F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842428] identity=46.6; qcov=1.01; evalue=2.69e-30; confidence=medium |
| Rice | Os07g0561300 (OsFbox396)- identity=41.5; qcov=0.588; evalue=1.91e-16; confidence=low |
| GO | GO:0005515 (protein binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985599 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057764646.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764646.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764646.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057764646.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057764646.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:7006985 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B20,C62,C77 |
Chr5:7007193 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B109,B37 |
Chr5:7007550 |
AAG |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 4 | B19,B42,B62,C13 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。