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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000890`

染色体: Chr05 坐标: 7051521-7053551 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000890`
名称	SmilChr05G000890
描述	vacuolar protein 8-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7051521 - 7053551 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985604`
GeneID	`130985604`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985604`
原始查询	`LOC130985604`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein 8-like
产物	vacuolar protein 8-like
Arabidopsis	`AT1G61350` (AT1G61350) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842429] identity=49.5; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0560300` - identity=42; qcov=1.02; evalue=2.01e-140; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00514 (Arm); PF23005 (DUF7032)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985604

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057764652.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057764652.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057764652.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764652.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764652.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7051877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C26
`Chr5:7051950`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B100,B102,B25,B75,C36,C50,C56,C7,C77
`Chr5:7052089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:7052138`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B25
`Chr5:7052138`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B25
`Chr5:7052480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B55,B88,C11,C82
`Chr5:7052498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C25
`Chr5:7052803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr5:7053047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A23,B118,B72,C57
`Chr5:7053092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:7053278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C31
`Chr5:7053308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A25,B127,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764652.1

552 aa

276

552

DUF7032

Arm

PF23005 DUF7032 8-110 aa PF00514 Arm 335-374 aa PF00514 Arm 419-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764652.1`	Pfam	`PF23005`	DUF7032	Domain	8	110	6.8e-31	107.2	Domain of unknown function (DUF7032)
`XP_057764652.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	335	374	3.7e-29	100.5	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`XP_057764652.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	419	455	3.7e-29	100.5	Armadillo/beta-catenin-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908669.1
CGAGGTGTGAGTGGTGATAGCTTGTGATAATATCTTCCAATTATGCGGAATTAAAGTGAAGCACATGCAGTCTGTTAGAAACCACAAAAGATAAGCATCTTCCAAAATTAAAATGGGTGAAGAAAACAGCGAAGCTATTCTGGTGATTTCTTCACTGATTTCTGCGTCCCATTCCATCAAAGTGTTCTCCGCCAAATGGCAATCCATCCGACACAAACTGGAGGAGCTCTTCTCCAACCTCGCCGCCATCCACAACTGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985604
ATGGGTGAAGAAAACAGCGAAGCTATTCTGGTGATTTCTTCACTGATTTCTGCGTCCCATTCCATCAAAGTGTTCTCCGCCAAATGGCAATCCATCCGACACAAACTGGAGGAGCTCTTCTCCAACCTCGCCGCCATCCACAACTGGGAATCCGCACTCCCCGCAGTTTCACACTCCATCTTAGCCACTCTCAACCACTGCCACCAGCTCGCCAAGCAGTGCTTGGACCTCTCATACAGCGGGAAGCTGCTTATGCAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764652.1
MGEENSEAILVISSLISASHSIKVFSAKWQSIRHKLEELFSNLAAIHNWESALPAVSHSILATLNHCHQLAKQCLDLSYSGKLLMQSDLDIVSAKIDAHINNIFDVYAAGLLTRTDAIVVSRPTAAASRDDVRFYVVDLLSRFKIGSTDMKKQALLAFNQVIQEDERYITVALRLDNFVGFLVNFLDFKDGEIQQEAAKCVCLIAGSESWKSALIGAGAIAPLIRVVESGNEASKELAATCLLLLTENSDNAWLVSAHGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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