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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002667`

染色体: Chr01 坐标: 44886469-44894970 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002667`
名称	SmilChr01G002667
描述	protein tesmin/TSO1-like CXC 5
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44886469 - 44894970 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985605`
GeneID	`130985605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985605`
原始查询	`LOC130985605`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein tesmin/TSO1-like CXC 5
产物	protein tesmin/TSO1-like CXC 5
Arabidopsis	`AT4G29000` (AT4G29000) Tesmin/TSO1-like CXC domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829021] identity=52.3; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0761100` - identity=48.4; qcov=0.959; evalue=1.29e-146; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03638 (TCR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764656.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764656.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764656.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764656.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764656.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44886817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,D4
`Chr1:44887097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr1:44887180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:44887284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,C31,C82
`Chr1:44887294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:44887319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B80,B87,C60,D11
`Chr1:44887364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:44887389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B80,B87,C60,D11
`Chr1:44888759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B111,B77,C73,D3
`Chr1:44890113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:44890188`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	123	A10,A16,A18,A19,A20,A4,A6,A9,B1,B100,B101,B103,B105,B108,B110,B114,B117,B118,B12,B122,B123,B124,B126,B129,B130,B131,B132,B134,B136,B137,B14,B17,B20,B23,B26,B28,B29,B30,B32,B33,B36,B39,B40,B42,B44,B45,B47,B48,B49,B54,B55,B56,B58,B60,B62,B68,B7,B70,B71,B74,B75,B77,B78,B8,B86,B88,B90,B91,B94,B95,B98,C10,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C22,C24,C26,C29,C31,C32,C33,C35,C36,C37,C4,C41,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C63,C64,C67,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C80,C9,D1,D3,D6,D7,D8
`Chr1:44890206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764656.1

593 aa

296

593

TCR

PF03638 TCR 117-152 aa PF03638 TCR 202-237 aa

XP_057764663.1

592 aa

296

592

TCR

PF03638 TCR 117-152 aa PF03638 TCR 202-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764656.1`	Pfam	`PF03638`	TCR	Domain	117	152	1.7e-24	86.5	Tesmin/TSO1-like CXC domain, cysteine-rich domain
`XP_057764656.1`	Pfam	`PF03638`	TCR	Domain	202	237	1.7e-24	86.5	Tesmin/TSO1-like CXC domain, cysteine-rich domain
`XP_057764663.1`	Pfam	`PF03638`	TCR	Domain	117	152	1.7e-24	86.5	Tesmin/TSO1-like CXC domain, cysteine-rich domain
`XP_057764663.1`	Pfam	`PF03638`	TCR	Domain	202	237	1.7e-24	86.5	Tesmin/TSO1-like CXC domain, cysteine-rich domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908673.1
CGAAATTGAATTTCAAAAGCTAAGCTAGAGAGGGAGGAAGGGGACTCAAAGCCAGCGAAACCAATTCAAAGAATTCTTCATCTGCGTGTGTGTGGTTTGTGTATATGTACATTGGAGTGTACATACGCGCATTTGTATCTATATGCGTCTGTAGGGATCGAGCTACCTCTCAATTGGGACGGAGATTTTTTTTTTGTCCTTTGAATTTTGTGGTGTTTTAATTGCGAGCTTGTTAAAATTATGACAGTCGAATTCGAATT...

XM_057908680.1
GAAATTGAATTTCAAAAGCTAAGCTAGAGAGGGAGGAAGGGGACTCAAAGCCAGCGAAACCAATTCAAAGAATTCTTCATCTGCGTGTGTGTGGTTTGTGTATATGTACATTGGAGTGTACATACGCGCATTTGTATCTATATGCGTCTGTAGGGATCGAGCTACCTCTCAATTGGGACGGAGATTTTTTTTTTGTCCTTTGAATTTTGTGGTGTTTTAATTGCGAGCTTGTTAAAATTATGACAGTCGAATTCGAATTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985605
ATGGAGCAAAGAGATGAACATGATTTCCCTCCAAAAAAGCCGCCGCCGCCGCAACCGGAAGCGACGACGGCAGGAGTTGATTTCCCAGCGAGGAAGCTGGTGAGGCAGCTGGATTTTACTGGTGGCGCGTCGACGATGGAGCAGCGGCAGCAAGTGAAGCTGGAGCAACCTCCTCCGCAGTTGCTGTCTCATTTAGTGAAGCCGCCGCCGCAGATGCTCTTCATGACTATGCAGCAACCACCTCCGCCGCCCTCTCATCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764656.1
MEQRDEHDFPPKKPPPPQPEATTAGVDFPARKLVRQLDFTGGASTMEQRQQVKLEQPPPQLLSHLVKPPPQMLFMTMQQPPPPPSHPSVRPPLKPESPRSRPGQNVNEIKDGTPKKQKQCNCKHSRCLKLYCECFASGVYCDGCNCVNCHNNVENDTARREAVEATLERNPTAFRPKIASSPHGARDNREEAGEIVSGKHNKGCHCKKSGCLKKYCECFQANILCSENCKCMDCKNYEGSEERQALFHGDHVNNMAFIQQ...

XP_057764663.1
MEQRDEHDFPPKKPPPPQPEATTAGVDFPARKLVRQLDFTGGASTMEQRQQVKLEQPPPQLLSHLVKPPPQMLFMTMQQPPPPPSHPSVRPPLKPESPRSRPGQNVNEIKDGTPKKQKQCNCKHSRCLKLYCECFASGVYCDGCNCVNCHNNVENDTARREAVEATLERNPTAFRPKIASSPHGARDNREEAGEIVSGKHNKGCHCKKSGCLKKYCECFQANILCSENCKCMDCKNYEGSEERQALFHGDHVNNMAFIQQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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