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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000907`

染色体: Chr05 坐标: 7176158-7179916 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000907`
名称	SmilChr05G000907
描述	uncharacterized SmilChr05G000907
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7176158 - 7179916 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985621`
GeneID	`130985621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985621`
原始查询	`LOC130985621`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PLAC8 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837680]; symbol=AT1G11380; hit=AT1G11380; species=arabidopsis; confidence=high
产物	PLAC8 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837680]; symbol=AT1G11380; hit=AT1G11380; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G11380` (AT1G11380) PLAC8 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837680] identity=46.2; qcov=1.03; evalue=5.26e-56; confidence=high
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04749 (PLAC8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764673.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057764672.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057764672.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057764672.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764673.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7176747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr5:7178101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B78,B82,C23
`Chr5:7178106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B79
`Chr5:7178132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B78,B82,C23
`Chr5:7179445`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A4
`Chr5:7179445`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764672.1

261 aa

130

261

PLAC8

PF04749 PLAC8 72-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764672.1`	Pfam	`PF04749`	PLAC8	Family	72	193	3.4e-19	70.3	PLAC8 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908690.1
ACCTAAACCCAACCCTTGCATATTTCGCTCTCTTATCTTTATAAATTACAATATACAATGATATGATTTTAGTATCAATCAATGTATATAGCATGATATTAACCCTCAACAGAAACATAAATTATAAAAACCCTCAAATTGCGTGGTGGGCGGAGCGCCCTTAATATATCCGTTGGCCCACCATCACATTAAACTGGCGCCAACCAGCATGCAACCATTCTTTGCTGCTTGCCTTTATACCCCGATAGAATCCCTCTCCA...

XM_057908689.1
ACCTAAACCCAACCCTTGCATATTTCGCTCTCTTATCTTTATAAATTACAATATACAATGATATGATTTTAGTATCAATCAATGTATATAGCATGATATTAACCCTCAACAGAAACATAAATTATAAAAACCCTCAAATTGCGTGGTGGGCGGAGCGCCCTTAATATATCCGTTGGCCCACCATCACATTAAACTGGCGCCAACCAGCATGCAACCATTCTTTGCTGCTTGCCTTTATACCCCGATAGAATCCCTCTCCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985621
ATGGCGGAGCTGGATAAGAGAGGTGGCGAACAGGCTGCGGCGGAGGAGGAGAGGTTGTTGGGGGAGGAAGCTGCCGTGTTGGATTTCGACACGCTCTGCTCAACCGTGGCGATGCAGGCGCAGCAGGGGAAATGGGGAAAGCTAAACGGAGATAATGAAGAGGAATATATTGTGTCTAATTTTCGTGAATATGGAGGCGGTGTGCATAGAATGTGGGAAGGTGAGCTCTTTTACGACTGCTTCGATGATCGGCGCCTCGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764672.1
MAELDKRGGEQAAAEEERLLGEEAAVLDFDTLCSTVAMQAQQGKWGKLNGDNEEEYIVSNFREYGGGVHRMWEGELFYDCFDDRRLALQSSCCPCYRFGKNMKRAGFGSCFLQGSIHLILLVIALSNLLAFTITRKCYFLYLAISFALSVGTYMGYYRIQIKKKFNIKGGDTSFDDFVYHVICPSCMLSQESRTLEMNNVQDGIWHGRGDTICVGSFSEDSKAYLELHPPFVVSTKCPQLLSMQQTSNDTIILPTSVVGI...

XP_057764673.1
MAELDKRGGEQAAAEEERLLGEEAAVLDFDTLCSTVAMQAQQGKWGKLNGDNEEEYIVSNFREYGGGVHRMWEGELFYDCFDDRRLALQSSCCPCYRFGKNMKRAGFGSCFLQGGDTSFDDFVYHVICPSCMLSQESRTLEMNNVQDGIWHGRGDTICVGSFSEDSKAYLELHPPFVVSTKCPQLLSMQQTSNDTIILPTSVVGIV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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