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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000908`

染色体: Chr05 坐标: 7185038-7188281 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000908`
名称	SmilChr05G000908
描述	universal stress protein PHOS32-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7185038 - 7188281 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985622`
GeneID	`130985622`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985622`
原始查询	`LOC130985622`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	universal stress protein PHOS32-like
产物	universal stress protein PHOS32-like
Arabidopsis	`AT1G11360` (AT1G11360) Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837678] identity=69.4; qcov=0.699; evalue=2.39e-111; confidence=high
Rice	`Os01g0783500` - identity=67.9; qcov=0.647; evalue=6.95e-83; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00582 (Usp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985622

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764674.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057764675.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057764674.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764674.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764674.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7185461`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr5:7185461`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr5:7185462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B22,C82
`Chr5:7185804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:7185811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B136,C4,D6
`Chr5:7185851`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr5:7185851`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr5:7185853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:7186220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C13
`Chr5:7186779`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A6,B104,B109,B26,B37,B59,B81,B89,C10,C29,C43,D10,D8
`Chr5:7186783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A6,B104,B109,B26,B37,B59,B81,B89,C10,C29,C43,D10,D8
`Chr5:7186785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764674.1

239 aa

120

239

Usp

PF00582 Usp 38-191 aa

XP_057764675.1

346 aa

173

346

Usp

PF00582 Usp 38-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764674.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	38	191	3.4e-27	96.4	Universal stress protein family
`XP_057764675.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	38	191	8.9e-27	95.1	Universal stress protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908691.1
GAAAAAGAAAAGAAAGAGTAATCTAAAAAGTCAACGTAAGTGCAGGAAGAAAATTAGATAGACCGGAAACATCTGATTTCTATCCCCGACCTTTCTTGTTCGGGAGCTAATCACAGTCGCCCGAAAACGCAAGAACGAGCCGAGTCATCAAATATTCAAAATCAACTCATCCACCCCTTGTTTACAACCCTGAAAAACCCTAATTCCATCTTCCCCCAAATCACACTCCACAGTTGATACAATTTTACTGCATGGCTTCA...

XM_057908692.1
TAGATAGACCGGAAACATCTGATTTCTATCCCCGACCTTTCTTGTTCGGGAGCTAATCACAGTCGCCCGAAAACGCAAGAACGAGCCGAGTCATCAAATATTCAAAATCAACTCATCCACCCCTTGTTTACAACCCTGAAAAACCCTAATTCCATCTTCCCCCAAATCACACTCCACAGTTGATACAATTTTACTGCATGGCTTCACCAGGCAAACCTCGGAAGGAAAACGACCGCCCGCCGGCCGCGATTCTCCACCAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985622
ATGGCTTCACCAGGCAAACCTCGGAAGGAAAACGACCGCCCGCCGGCCGCGATTCTCCACCAGCCAGCTTCTCCTCGCTTCCCTTCCGGAACTCCCACCGCAGGCGCCCAGCGCAAGGTCGCCATCGCAGTAGATCTCAGTGATGAGAGCGCCTACGCCGTCAAGTGGGCTGTCCAGAATTACCTCCGGCCGGGCGACGCCGTCATTCTCCTACACGTGCGCCCCACCTCCGTCCTGTACGGCGCTGATTGGGGCGCCGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764674.1
MASPGKPRKENDRPPAAILHQPASPRFPSGTPTAGAQRKVAIAVDLSDESAYAVKWAVQNYLRPGDAVILLHVRPTSVLYGADWGAVDVSVDTADEKSQQKLEDDFDNFTTSKANDLAQPLVEASIPFKIHIVKDHDMKERLCLEVERLGLSAVIMGSRGFGASRRSSKGRLGSVSDYCVHHCVCPVVVVRFPDEKDDVSGGSAKPLDKDTSALHPVPEEEEPLFLDASDQNADVEKTS

XP_057764675.1
MASPGKPRKENDRPPAAILHQPASPRFPSGTPTAGAQRKVAIAVDLSDESAYAVKWAVQNYLRPGDAVILLHVRPTSVLYGADWGAVDVSVDTADEKSQQKLEDDFDNFTTSKANDLAQPLVEASIPFKIHIVKDHDMKERLCLEVERLGLSAVIMGSRGFGASRRSSKGRLGSVSDYCVHHCVCPVVVVRFPDEKDDVSGGSAKPLDKDTSALHPVPEEEEPLFLDASDQNADEYSDGMCTCKMEKLRVAFESMVMLGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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