当前解析结果
SmilChr05G000914| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000914 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000914 |
| 描述 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g11330 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 7249144 - 7252026 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130985634 |
|---|---|
| GeneID | 130985634 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985634 |
| 原始查询 | LOC130985634 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g11330 |
| 产物 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g11330 |
| Arabidopsis | AT1G11330 (AT1G11330)S-locus lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837675] identity=50.5; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os07g0551300 (OSJNBb0041B22.109)- identity=50.4; qcov=0.887; evalue=7.3e-161; confidence=high |
| GO | GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0048544 (recognition of pollen) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00069 (Pkinase); PF00954 (S_locus_glycop); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08276 (PAN_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985634 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057764690.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057764690.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764690.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764690.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057764690.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:7250101 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B105 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057764690.1PF00954
S_locus_glycop 29-62 aa
PF08276
PAN_2 88-147 aa
PF00069
Pkinase 253-519 aa
PF07714
PK_Tyr_Ser-Thr 255-520 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057764690.1 |
Pfam | PF00954 |
S_locus_glycop | Domain | 29 | 62 | 6.6e-06 | 27.4 | S-locus glycoprotein domain |
XP_057764690.1 |
Pfam | PF08276 |
PAN_2 | Domain | 88 | 147 | 1.7e-10 | 41.6 | PAN-like domain |
XP_057764690.1 |
Pfam | PF00069 |
Pkinase | Domain | 253 | 519 | 2.3e-46 | 159.1 | Protein kinase domain |
XP_057764690.1 |
Pfam | PF07714 |
PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 255 | 520 | 4.3e-48 | 164.6 | Protein tyrosine and serine/threonine kinase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。