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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000982`

染色体: Chr05 坐标: 7935681-7938272 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000982`
名称	SmilChr05G000982
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g11330
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7935681 - 7938272 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985700`
GeneID	`130985700`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985700`
原始查询	`LOC130985700`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g11330
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g11330
Arabidopsis	`AT1G11330` (AT1G11330) S-locus lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837675] identity=46.5; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0551300` (OSJNBb0041B22.109) - identity=43.7; qcov=1.04; evalue=8.92e-161; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0048544 (recognition of pollen)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00954 (S_locus_glycop); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08276 (PAN_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764770.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764770.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764770.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764770.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764770.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7936121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B136
`Chr5:7936227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr5:7936378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr5:7936382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B79,C54,D2
`Chr5:7936551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B74
`Chr5:7936582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C58
`Chr5:7937055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B133,C30
`Chr5:7937060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:7937244`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B43
`Chr5:7937244`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B43
`Chr5:7937247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr5:7937483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B75,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764770.1

594 aa

297

594

S_locus_glycop

PAN_2

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00954 S_locus_glycop 5-93 aa PF08276 PAN_2 115-175 aa PF00069 Pkinase 281-486 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 284-553 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764770.1`	Pfam	`PF00954`	S_locus_glycop	Domain	5	93	3.2e-21	76.7	S-locus glycoprotein domain
`XP_057764770.1`	Pfam	`PF08276`	PAN_2	Domain	115	175	4.5e-14	53.0	PAN-like domain
`XP_057764770.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	281	486	2.1e-43	149.3	Protein kinase domain
`XP_057764770.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	284	553	6.9e-45	154.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908787.1
TACAGGGAAGCATGTGGTGGTGTCGGCGTGGAAAAACACCAGCGATCCGGAGATAGGGAGCTTCACCGCCGGCCTCGACGTCATAAACGGGATCCCACAACTTTTCGCATGGAATGAGGGGCGGCCGCACTGGAGGAGCGGGCCGTGGAACGGGCTGATATTTCTGGGGATAAAGGAGATGTTCTACGCCTACTTGGACGGCTTCACTCAAGTGACGAACGACAGCGCTGGCAATTTCTTCTACACCAAGCCGCAGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985700
ATGTTCTACGCCTACTTGGACGGCTTCACTCAAGTGACGAACGACAGCGCTGGCAATTTCTTCTACACCAAGCCGCAGGAGAATGTGTACATAACGGCCAGCGTAAATTCTTCGGGAAATGTGTTGCGGAAAGTATGGAATGGCATCGAGAAGAGATGGGTCGTGGAGTGGACGACTCCTGAAAACGAATGCGATGTTTATGGCAAGTGCGGGCCCTTTGGTAGCTGTAATGCTCTGCAGTCGCCTATCTGTACTTGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764770.1
MFYAYLDGFTQVTNDSAGNFFYTKPQENVYITASVNSSGNVLRKVWNGIEKRWVVEWTTPENECDVYGKCGPFGSCNALQSPICTCLRGFEPAKEDEWGRGNWTNGCRRRNQLQCGKGDRFQRFQYMKVPDFAQPLLSRVKDECRTTCMANCSCIAYAYDPNIGCMFWNNTLIDTQEFDRDGVDLYIRLSASEFDSHKGRKLYIIIPVAVGVFISIMIFIAWWLMVKSKGDKAKDTSILEAGQMFTTDSTAIVLRDESNE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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